RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	LRBA	P50851	2863 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NF1	P21359	2839 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ARGFX	A6NJG6	315 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	VEGFD	O43915	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	KCNJ13	O60928	360 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CDK14	O94921	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CLDN7	O95471	211 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SOD1	P00441	154 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	IGHE	P01854	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	C9	P02748	559 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PDHA1	P08559	390 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CD63	P08962	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FGF5	P12034	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF28	P17035	718 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PRKCA	P17252	672 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	F8A1	P23610	371 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PCK1	P35558	622 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CAPZB	P47756	277 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SPINT3	P49223	89 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CLCNKA	P51800	687 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GFER	P55789	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	HSD11B2	P80365	405 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TRAF2	Q12933	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	DPYS	Q14117	519 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	KRT33B	Q14525	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	KRT31	Q15323	416 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	DPYSL2	Q16555	572 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	KYNU	Q16719	465 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CA9	Q16790	459 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	UGT8	Q16880	541 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ODF2	Q5BJF6	829 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MED25	Q71SY5	747 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	IQCK	Q8N0W5	287 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CCNY	Q8ND76	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CT55	Q8WUE5	264 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CPT1B	Q92523	772 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MR1	Q95460	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CD180	Q99467	661 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RAB33B	Q9H082	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	OR2AG1	Q9H205	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FGF21	Q9NSA1	209 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GPR83	Q9NYM4	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CHKB	Q9Y259	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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