RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483485.5

SNX5-211, Transcript of sorting nexin 5, humanhuman

TSL 2

Gene SNX5, Length 3,087 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5-211ENST00000483485 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.4□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 CCDC167Q9P0B6 97 aa7.4□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 E5RI56 91 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 H3BNX3 289 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 PIP5K1BO14986 540 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 KLK8O60259 260 aa7.39□□□□□ -1.23
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SNX5-211ENST00000483485 BCL2L1Q07817 233 aa7.39□□□□□ -1.23
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SNX5-211ENST00000483485 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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SNX5-211ENST00000483485 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.231e-8■■■■■ 28.8
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SNX5-211ENST00000483485 P2RY12Q9H244 342 aa7.39□□□□□ -1.23
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SNX5-211ENST00000483485 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa7.39□□□□□ -1.23
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SNX5-211ENST00000483485 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.39□□□□□ -1.23
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SNX5-211ENST00000483485 KIAA0355O15063 1070 aa7.38□□□□□ -1.23
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SNX5-211ENST00000483485 NR1H2P55055 460 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 STX1BP61266 288 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 PSME3P61289 254 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 ECT2LQ008S8 904 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 ITGADQ13349 1161 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 GRB7Q14451 532 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 PON2Q15165 354 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 CYP20A1Q6UW02 462 aa7.38□□□□□ -1.23
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