RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482558.5

SNX13-208, Transcript of sorting nexin 13, human

TSL 2

Gene SNX13, Length 1,139 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX13-208	ENST00000482558	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ARMCX1	Q9P291	453 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558		A0A1B0GVM2	712 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558		A0A1W2PPL8	197 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	C2orf81	A6NN90	581 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	SLC16A6	O15403	523 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	B4GALT3	O60512	393 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	SMIM24	O75264	130 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	EFEMP2	O95967	443 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	COX4I1	P13073	169 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	PFKL	P17858	780 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	BMP7	P18075	431 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	GABRB3	P28472	473 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ALDH1A3	P47895	512 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	SUOX	P51687	545 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	NAGLU	P54802	743 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ARPP19	P56211	112 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	TAS2R39	P59534	338 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ATP6V0D1	P61421	351 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	GNA12	Q03113	381 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	UBE3A	Q05086	875 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	DUSP4	Q13115	394 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	CTBP1	Q13363	440 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	OLIG2	Q13516	323 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	CES4A	Q5XG92	561 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ITIH5	Q86UX2	942 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	LGI2	Q8N0V4	545 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	LILRA2	Q8N149	483 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	IGSF8	Q969P0	613 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ZNF778	Q96MU6	729 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	GPR78	Q96P69	363 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	OMD	Q99983	421 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	SEMA3C	Q99985	751 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	EBF4	Q9BQW3	602 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	THTPA	Q9BU02	230 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	RNF32	Q9H0A6	362 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	PDF	Q9HBH1	243 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	XPR1	Q9UBH6	696 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	TTC3	P53804	2025 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	SYCE1L	A8MT33	242 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558		A8MUI8	341 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558		F8W810	466 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558		J3KR12	359 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNX13-208	ENST00000482558	ARNTL	O00327	626 aa		7.6	□□□□□ -1.19

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