RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479230.5

GNL3-208, Transcript of G protein nucleolar 3, human

TSL 4

Gene GNL3, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNL3-208	ENST00000479230	LPGAT1	Q92604	370 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ASCL2	Q99929	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	GLI2	P10070	1586 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230		A0A1W2PN81	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	HYKK	A2RU49	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	GLOD5	A6NK44	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	DNM1L	O00429	736 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	TSPAN1	O60635	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	PIGN	O95427	931 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	BCL10	O95999	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	SLC6A6	P31641	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	MAP2K2	P36507	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	CHRNA7	P36544	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	KCNJ10	P78508	379 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	GRHL3	Q8TE85	626 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	NSL1	Q96IY1	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	OR10H2	O60403	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	BEST1	O76090	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	PGM3	O95394	542 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	EML2	O95834	649 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	EDN1	P05305	212 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	LDHC	P07864	332 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	BDNF	P23560	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	DCAF10	Q5QP82	559 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	SCML4	Q8N228	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ADGRL1	O94910	1474 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	NR5A2	O00482	541 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	NGF	P01138	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	CEACAM1	P13688	526 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	WNT5A	P41221	380 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	HILS1	P60008	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	PRKCZ	Q05513	592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	GPR17	Q13304	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	EEA1	Q15075	1411 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	FCN2	Q15485	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	TAF13	Q15543	124 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ZNF790	Q6PG37	636 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	EXD1	Q8NHP7	514 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	GIMAP5	Q96F15	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	OLFM1	Q99784	485 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GNL3-208	ENST00000479230	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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