RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460258.5

NOP56-204, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 4

Gene NOP56, Length 837 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-204ENST00000460258 DLG3Q92796 817 aa11.92□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 C12orf66Q96MD2 445 aa11.92□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 ZNF599Q96NL3 588 aa11.92□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 PDCL3Q9H2J4 239 aa11.92□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 SRMSQ9H3Y6 488 aa11.92□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 TEKT2Q9UIF3 430 aa11.92□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 BTN3A3O00478 584 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 BTN3A1O00481 513 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 YEATS4O95619 227 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 NID1P14543 1247 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 CD46P15529 392 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 KLC1Q07866 573 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 TUBA3CQ13748 450 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 NFE2L1Q14494 772 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 ZIC1Q15915 447 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 TUBA3EQ6PEY2 450 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 PRSS58Q8IYP2 241 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 AMER2Q8N7J2 671 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 OR5M3Q8NGP4 307 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 CCHCR1Q8TD31 782 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 PIP5K1AQ99755 562 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 NUP85Q9BW27 656 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 WWP1Q9H0M0 922 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 C3orf18Q9UK00 162 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 PCDHA7Q9UN72 937 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 ALG6Q9Y672 507 aa11.91□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 DYSFO75923 2080 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 ZNF407Q9C0G0 2248 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 C2CD4BA6NLJ0 364 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 DNAJB6O75190 326 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 POP7O75817 140 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 PEX11BO96011 259 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 CYP11B1P15538 503 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 SYT1P21579 422 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 TACR1P25103 407 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 CHRNA4P43681 627 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 GCGRP47871 477 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 OR1C1Q15619 314 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 CCDC40Q4G0X9 1142 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 EMC4Q5J8M3 183 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 KAZNQ674X7 775 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 SPINK14Q6IE38 97 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 SCYL2Q6P3W7 929 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 NLRP9Q7RTR0 991 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 BEST3Q8N1M1 668 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 NPWQ8N729 165 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 JOSD2Q8TAC2 188 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 LCN9Q8WX39 176 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 PERPQ96FX8 193 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 LYSMD1Q96S90 227 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 RIC8BQ9NVN3 520 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 ANKRD10Q9NXR5 420 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 FZD10Q9ULW2 581 aa11.9□□□□□ -0.5
NOP56-204ENST00000460258 SCN2AQ99250 2005 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 SERINC4A6NH21 518 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 FAM157CP0CG43 387 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 NDUFS1P28331 727 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 CD96P40200 585 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 OR1D4P47884 311 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 ME1P48163 572 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 ST13P50502 369 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 ARSFP54793 590 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 AP2B1P63010 937 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 GTF2H3Q13889 308 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 KRT33BQ14525 404 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 PDPK2PQ6A1A2 396 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 TRIM73Q86UV7 250 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 HOOK3Q86VS8 718 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 BBS5Q8N3I7 341 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 TRAM1L1Q8N609 369 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 MSANTD4Q8NCY6 345 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 GPR26Q8NDV2 337 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 ROBO4Q8WZ75 1007 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 NRTNQ99748 197 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 LRTM1Q9HBL6 345 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 CHKBQ9Y259 395 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa11.89□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 A0A0G2JNJ9 132 aa11.88□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 A0A1W2PPR1 153 aa11.88□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 A0A1W2PQ72 361 aa11.88□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 CLCA1A8K7I4 914 aa11.88□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 A8MUI8 341 aa11.88□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 C2orf74A8MZ97 194 aa11.88□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 SYT5O00445 386 aa11.88□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 EPXP11678 715 aa11.88□□□□□ -0.51
NOP56-204ENST00000460258 CXCR2P25025 360 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms