RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454323.1

CUL3-208, Transcript of cullin 3, human

TSL 3

Gene CUL3, Length 688 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUL3-208	ENST00000454323	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TCF4	P15884	667 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	GNAZ	P19086	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	CD86	P42081	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	KHK	P50053	298 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	IL1RL1	Q01638	556 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	CBX3	Q13185	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	PPA1	Q15181	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TMEM270	Q6UE05	265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TEKT1	Q969V4	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TMEM237	Q96Q45	408 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	THAP9	Q9H5L6	903 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	POLL	Q9UGP5	575 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	MYOM2	P54296	1465 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	CLDN4	O14493	209 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	TLR2	O60603	784 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	MED24	O75448	989 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	VNN2	O95498	520 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	TSPY4	P0CV99	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	TSPY10	P0CW01	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	KCNJ1	P48048	391 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	P2RX3	P56373	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	STARD6	P59095	220 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	PTEN	P60484	403 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	FOXM1	Q08050	763 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	UGCG	Q16739	394 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	MON1B	Q7L1V2	547 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	NR4A3	Q92570	626 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	SEPHS2	Q99611	448 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	SEMA3C	Q99985	751 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	VPS18	Q9P253	973 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	EP400	Q96L91	3159 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	PGRMC2	O15173	223 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	ZBTB43	O43298	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	XRCC3	O43542	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	OR10H2	O60403	315 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	ZIC3	O60481	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	TSPAN1	O60635	241 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	SEC22B	O75396	215 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	HMOX1	P09601	288 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	CDC25A	P30304	524 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	BDKRB2	P30411	391 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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