RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa13.29□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 BRWD1Q9NSI6 2320 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 FGBP02675 491 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR5P61964 334 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 LSM3P62310 102 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 TUBA1BP68363 451 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 LIN52Q52LA3 116 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 IER5LQ5T953 404 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 TUBA1AQ71U36 451 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 SCML4Q8N228 414 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 BADQ92934 168 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 EID2BQ96D98 161 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 EGLN2Q96KS0 407 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 RANBP9Q96S59 729 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 DGCR6LQ9BY27 220 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 TDP1Q9NUW8 608 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 KIF17Q9P2E2 1029 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 LATO43561 262 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 SRCP12931 536 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 GNPDA1P46926 289 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 ST13P50502 369 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 TNK2Q07912 1038 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC26Q2I0M4 334 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM220Q6QAJ8 160 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 HS3ST5Q8IZT8 346 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 TSPAN14Q8NG11 270 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2T12Q8NG77 320 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 TOP1MTQ969P6 601 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 ISL2Q96A47 359 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 VMP1Q96GC9 406 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2AG1Q9H205 316 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 SIP14410 1827 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 MGAT4DA6NG13 374 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 CACNG3O60359 315 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNH1O95259 989 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 RHOP08100 348 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 HMGCLP35914 325 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 ACSM2AQ08AH3 577 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 ACSM2BQ68CK6 577 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 OSCP1Q8WVF1 389 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 DPF3Q92784 378 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 ASB2Q96Q27 587 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 CHID1Q9BWS9 393 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 PDFQ9HBH1 243 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 H3BNX3 289 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 hCG_2039718K7EN88 272 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 SOCS2O14508 198 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 MFN2O95140 757 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 GNAO1P09471 354 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 SELPLGQ14242 412 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 NANOGP8Q6NSW7 305 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 NANOGQ9H9S0 305 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 CAPN10Q9HC96 672 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 NOTOA8MTQ0 251 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 GRM6O15303 877 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 COL6A1P12109 1028 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 GPX3P22352 226 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 CCR2P41597 374 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR1P46091 355 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 TCEAL5Q5H9L2 206 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 CHSY3Q70JA7 882 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 RGL4Q8IZJ4 473 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 NXPE1Q8N323 547 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNJ9Q92806 393 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 PANX1Q96RD7 426 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 DHRS7Q9Y394 339 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa13.27□□□□□ -0.28
RABGEF1-210ENST00000437078 EVPLLA8MZ36 301 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 CYP2A7P20853 494 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 IRS1P35568 1242 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 SEC13P55735 322 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 ERVK-8P63133 956 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 CARD16Q5EG05 197 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 OR4F3Q6IEY1 312 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 TXNDC11Q6PKC3 985 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 ZSWIM9Q86XI8 627 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 DLG3Q92796 817 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 MYO1DO94832 1006 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 PRKCQQ04759 706 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 PIGFQ07326 219 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 GRIN2CQ14957 1233 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 CEP78Q5JTW2 689 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 HAUS8Q9BT25 410 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 RIBC2Q9H4K1 309 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGEF1-210ENST00000437078 TMCO1Q9UM00 188 aa13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.8 ms