RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HNMTP50135 292 aa18.28■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRKCQQ04759 706 aa18.28■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PWP1Q13610 501 aa18.28■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIX1Q8N485 282 aa18.28■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBTB18Q99592 522 aa18.28■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CGREF1Q99674 301 aa18.28■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC8A2Q9UPR5 921 aa18.28■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHD7Q9P2D1 2997 aa18.28■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FADS2P1A8MWK0 482 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC16A5O15375 505 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOX11P35716 441 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYBPC1Q00872 1141 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBE3AQ05086 875 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GGTA1PQ4G0N0 100 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIN52Q52LA3 116 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CACHD1Q5VU97 1274 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP4R4Q6NUP7 873 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GALNT13Q8IUC8 556 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAM1L1Q8N609 369 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDHD1Q8NEL9 900 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC13A3Q8WWT9 602 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 P2RY13Q9BPV8 354 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CENPKQ9BS16 269 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OSBPL11Q9BXB4 747 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf109Q9NX04 203 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO10Q9UK96 956 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa18.27■□□□□ 0.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TPST1O60507 370 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AP2A2O94973 939 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGEF15O94989 841 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMIM18P0DKX4 95 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP2A7P20853 494 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FASP25445 335 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFKBIAP25963 317 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4D2P58180 307 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTPNP58546 118 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SELPLGQ14242 412 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DHCR24Q15392 516 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTCHD3Q3KNS1 767 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF805Q5CZA5 627 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRPV3Q8NET8 790 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELMO1Q92556 727 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC3BQ96PB8 259 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACPTQ9BZG2 426 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPY30Q9C005 99 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIF1Q9H611 641 aa18.27■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC01553A4QN01 128 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOCS2O14508 198 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNFAIP8O95379 198 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDYNP01213 254 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP17A1P05093 508 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HRH2P25021 359 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEK5Q6P3R8 708 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUSD1Q6UWL2 747 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEK10Q6ZWH5 1172 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPPA4Q7L190 304 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PYCR2Q96C36 320 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAD18Q9NS91 495 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DKK3Q9UBP4 350 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM149AA5PLN7 773 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT87PA6NCN2 255 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SAC3D1A6NKF1 404 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2AG2A6NM03 316 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNH1O95259 989 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FTH1P02794 183 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM58BPP0C7Q3 252 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSMC3P17980 439 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XPAP23025 273 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DGKGP49619 791 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLCN2P51788 898 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AP1S2P56377 157 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLIN5Q00G26 463 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POM121L1PQ3SYA9 428 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC30A9Q6PML9 568 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ISLR2Q6UXK2 745 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PROSER1Q86XN7 944 aa18.26■□□□□ 0.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EPHX4Q8IUS5 362 aa18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms