RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM9Q9P0T7 183 aa20.24■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 PDP2Q9P2J9 529 aa20.24■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 FETUBQ9UGM5 382 aa20.24■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 VWA7Q9Y334 891 aa20.24■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 TNFSF15O95150 251 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 TYRP1P17643 537 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 AOAHP28039 575 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 SERPINB9P50453 376 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 SLC12A2P55011 1212 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 TTLL9Q3SXZ7 439 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 ZBTB2Q8N680 514 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 RCBTB1Q8NDN9 531 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 ASZ1Q8WWH4 475 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 SLC46A1Q96NT5 459 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 GPR21Q99679 349 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 GPR22Q99680 433 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 ASCL3Q9NQ33 180 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 OGFRQ9NZT2 677 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 KLHL42Q9P2K6 505 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 PISDQ9UG56 409 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 SLC24A2Q9UI40 661 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.23■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 APC2O95996 2303 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 ACACAQ13085 2346 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 SLC5A10A0PJK1 596 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 NUDT17P0C025 328 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 SAT1P21673 171 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 CD9P21926 228 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 FDXRP22570 491 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 MPSTP25325 297 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 PDHA2P29803 388 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 CLCN7P51798 805 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 CDKN2DP55273 166 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 POU4F1Q01851 419 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 HSPA14Q0VDF9 509 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 SNAP47Q5SQN1 464 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 RSC1A1Q92681 617 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 FGF11Q92914 225 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 TSPAN17Q96FV3 270 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 LATS2Q9NRM7 1088 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 MED16Q9Y2X0 877 aa20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 PMS2P1A4D2B8 440 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 KRT38O76015 456 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 C9P02748 559 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 SHBGP04278 402 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 ANKRD34CP0C6C1 535 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 HGFP14210 728 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 CNTFP26441 200 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 IFFO1Q0D2I5 559 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 USP10Q14694 798 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 LGSNQ5TDP6 509 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 CLEC14AQ86T13 490 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 OOSP2Q86WS3 158 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 CNPY4Q8N129 248 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 INPP5DQ92835 1189 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 TGM7Q96PF1 710 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 FERD3LQ96RJ6 166 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 OLFM1Q99784 485 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 RAB33BQ9H082 229 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 EPHA6Q9UF33 1036 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 KLHL3Q9UH77 587 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 RAXQ9Y2V3 346 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 DHRS7Q9Y394 339 aa20.21■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 CDRT15L2A8MXV6 281 aa20.2■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 GPC4O75487 556 aa20.2■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 GFERP55789 205 aa20.2■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ARMC6Q6NXE6 501 aa20.2■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 IRGCQ6NXR0 463 aa20.2■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 SLC22A15Q8IZD6 547 aa20.2■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.2■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CD200R1Q8TD46 325 aa20.2■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 HGH1Q9BTY7 390 aa20.2■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 GALPQ9UBC7 116 aa20.2■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ASF1AQ9Y294 204 aa20.2■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms