RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CCNYL3P0C7X3 344 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CKBP12277 381 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 IL7P13232 177 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 IL1RNP18510 177 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CDC25CP30307 473 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GJA9P57773 515 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HSPB2Q16082 182 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CTC1Q2NKJ3 1217 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF227Q86WZ6 799 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CLEC10AQ8IUN9 316 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MED30Q96HR3 178 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 EPYCQ99645 322 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SYT15Q9BQS2 421 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MARCH7Q9H992 704 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SNX15Q9NRS6 342 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PTGFRNQ9P2B2 879 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PRKAG3Q9UGI9 489 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GLI3P10071 1580 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0G2JMP0 313 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0J9YYE9 177 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SYN3O14994 580 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CSPG5O95196 566 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NFICP08651 508 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HLA-EP13747 358 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ACVR2AP27037 513 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ADH6P28332 368 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HTR1EP28566 365 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GRK5P34947 590 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PFKPQ01813 784 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LSAMPQ13449 338 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PWP1Q13610 501 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CLCA4Q14CN2 919 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MED22Q15528 200 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 USP41Q3LFD5 358 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ACTBL2Q562R1 376 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SH3D19Q5HYK7 790 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LBX2Q6XYB7 198 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OR4M2Q8NGB6 313 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 C7orf43Q8WVR3 580 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 BTN2A3PQ96KV6 586 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GAREM1Q9H706 876 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB26Q9HCK0 441 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MAN1C1Q9NR34 630 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ATRNL1Q5VV63 1379 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CASKO14936 926 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RARRES1P49788 294 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OR2B6P58173 313 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 RPS7P62081 194 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HSPA14Q0VDF9 509 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC1A5Q15758 541 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 IL27RAQ6UWB1 636 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MON1BQ7L1V2 547 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MINDY1Q8N5J2 469 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 THAP6Q8TBB0 222 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TRIB2Q92519 343 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LPGAT1Q92604 370 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OTUB2Q96DC9 234 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GSDMCQ9BYG8 508 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LRTM1Q9HBL6 345 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC39A1Q9NY26 324 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CNTN3Q9P232 1028 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LRP5LA4QPB2 252 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DISC1C4P0D8 188 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SOCS7O14512 581 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TOR1AO14656 332 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NPC1O15118 1278 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A12O75746 678 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RETP07949 1114 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FPR1P21462 350 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ICAM3P32942 547 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 BCL2L1Q07817 233 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TOMM20Q15388 145 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FAM162BQ5T6X4 162 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLX4IPQ5VYV7 408 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RTL4Q6ZR62 310 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CHMP1BQ7LBR1 199 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC47A2Q86VL8 602 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 Q8N402 240 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MAPK15Q8TD08 544 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 KCTD4Q8WVF5 259 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PMM1Q92871 262 aa4.83□□□□□ -1.64
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