RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 SSR3Q9UNL2 185 aa20.34■□□□□ 0.85
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NISCH-201ENST00000345716 GJB5O95377 273 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-201ENST00000345716 CDH12P55289 794 aa20.34■□□□□ 0.85
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NISCH-201ENST00000345716 OR4F6Q8NGB9 312 aa20.34■□□□□ 0.85
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NISCH-201ENST00000345716 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
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NISCH-201ENST00000345716 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.844e-9■□□□□ 8.7
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NISCH-201ENST00000345716 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.32■□□□□ 0.84
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NISCH-201ENST00000345716 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 FRG2BQ96QU4 278 aa20.32■□□□□ 0.84
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NISCH-201ENST00000345716 AHSA2Q719I0 299 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 FAM220AQ7Z4H9 259 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 KCNA7Q96RP8 456 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.32■□□□□ 0.84
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NISCH-201ENST00000345716 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.31■□□□□ 0.84
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NISCH-201ENST00000345716 CBSLP0DN79 551 aa20.31■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 CBSP35520 551 aa20.31■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 UFM1P61960 85 aa20.31■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 ZNF846Q147U1 533 aa20.31■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.31■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
NISCH-201ENST00000345716 TXLNGYQ9BZA5 131 aa20.31■□□□□ 0.84
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