RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDE7BQ9NP56 450 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGF21Q9NSA1 209 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOHLH2Q9NX45 425 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTR10Q9NZ32 417 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF14Q9UBS8 474 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 RARRES3Q9UL19 164 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 KPNA5O15131 536 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 PFDN6O15212 129 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTI1O43156 1089 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPAG6O75602 509 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA0754O94854 1291 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 S1PR4O95977 384 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ST6GAL1P15907 406 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGAM1P18669 254 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 PKLRP30613 574 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC1A2P43004 574 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAFAH1B1P43034 410 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHDQ02161 417 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABRQ12979 859 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRB7Q14451 532 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 GBX1Q14549 363 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR19Q15760 415 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 LONRF1Q17RB8 773 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 OTOAQ7RTW8 1153 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 UNC5BQ8IZJ1 945 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP61Q8NHU2 1237 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC9Q92623 222 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM136AQ96C01 138 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 MENTQ9BUN1 341 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM169AQ9Y6X4 670 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIPSLA2A3N6 862 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3BMM5 538 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPTBP11277 2137 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 PKMP14618 531 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 PVRP15151 417 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT2B7P16662 529 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBB4BP68371 445 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABHD18Q0P651 414 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTBP1Q13363 440 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBB2AQ13885 445 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRYMQ14894 314 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 MORF4L2Q15014 288 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPESP1Q6UW49 350 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM73Q86UV7 250 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 LMNTD2Q8IXW0 634 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ESX1Q8N693 406 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALNT6Q8NCL4 622 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBB2BQ9BVA1 445 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPHK1Q9NYA1 384 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6C2Q9NZP2 312 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALPQ9UBC7 116 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 CIDEBQ9UHD4 219 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 NFS1Q9Y697 457 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATMQ13315 3056 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVH48-1M5A8F1 160 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDM1AO60341 852 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPN2P04844 631 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 STAT5AP42229 794 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 BDKRB1P46663 353 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB28P51157 221 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 KYNUQ16719 465 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMTC4Q5T4D3 741 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGDCC3Q8IVU1 814 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB2Q8N680 514 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 PWWP2AQ96N64 755 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2A14Q96R47 310 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT12Q99456 494 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL25Q9H0H3 589 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 TP73O15350 636 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP5DP30049 168 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ETF1P62495 437 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPP1Q00013 466 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 BBS9Q3SYG4 887 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF549Q6P9A3 640 aa18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms