RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 MAGEB3O15480 346 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 HOXA2O43364 376 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 TBL1XO60907 577 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 TRIM16O95361 564 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 LATS1O95835 1130 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 EPB42P16452 691 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 C6orf141Q5SZD1 244 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 MACC1Q6ZN28 852 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 WBP2Q969T9 261 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 OR52E6Q96RD3 313 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 SMURF2Q9HAU4 748 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 C1orf109Q9NX04 203 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 LMCD1Q9NZU5 365 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 VPS51Q9UID3 782 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 OR51B4Q9Y5P0 310 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 PRSS21Q9Y6M0 314 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 ERN1O75460 977 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 HMGCS1Q01581 520 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 NPAS4Q8IUM7 802 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 RGL4Q8IZJ4 473 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 SPARTQ8N0X7 666 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 EID3Q8N140 333 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 ULK4Q96C45 1275 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 ZFP14Q9HCL3 533 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 C3orf18Q9UK00 162 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 PDE10AQ9Y233 779 aa27.4■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 PRKD3O94806 890 aa27.39■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 OR1D2P34982 312 aa27.39■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 GDF5P43026 501 aa27.39■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 CRIPAKQ8N1N5 446 aa27.39■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 OR5K1Q8NHB7 308 aa27.39■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 HTATIP2Q9BUP3 242 aa27.39■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa27.39■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 LHPPQ9H008 270 aa27.39■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 PSME2Q9UL46 239 aa27.39■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 TRIM17Q9Y577 477 aa27.39■■□□□ 1.98
UBP1-201ENST00000283628 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 ZNF12P17014 697 aa27.39■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 C21orf59P57076 290 aa27.39■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 BNIP3Q12983 259 aa27.39■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa27.39■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 TTLL9Q3SXZ7 439 aa27.39■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 TTC23LQ6PF05 361 aa27.39■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 CLDN19Q8N6F1 224 aa27.39■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 DCAF4L2Q8NA75 395 aa27.39■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 TANKQ92844 425 aa27.39■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 IL26Q9NPH9 171 aa27.39■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 BACE2Q9Y5Z0 518 aa27.39■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 LOC730098B7Z3J9 87 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 CBFA2T3O75081 653 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 DNAJB5O75953 348 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 BCL10O95999 233 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 TRBC1P01850 177 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 IL7RP16871 459 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 UGT1A1P22309 533 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 UGT1A4P22310 534 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 UGT1A3P35503 534 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 UGT1A5P35504 534 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 IST1P53990 364 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 PON2Q15165 354 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 GPR33Q49SQ1 333 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 SUSD1Q6UWL2 747 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 CALHM3Q86XJ0 350 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 PLPP6Q8IY26 295 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 SAGE1Q9NXZ1 904 aa27.38■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 CREG1O75629 220 aa27.37■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 CA5AP35218 305 aa27.37■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 KCNAB2Q13303 367 aa27.37■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 RFX4Q33E94 735 aa27.37■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 CDKL4Q5MAI5 379 aa27.37■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 LRIF1Q5T3J3 769 aa27.37■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 SPESP1Q6UW49 350 aa27.37■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 XKR5Q6UX68 686 aa27.37■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 FAM9CQ8IZT9 166 aa27.37■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 DDHD1Q8NEL9 900 aa27.37■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHA8Q96JA3 519 aa27.37■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 TBCDQ9BTW9 1192 aa27.37■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 KCNH6Q9H252 994 aa27.37■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 LATS2Q9NRM7 1088 aa27.37■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 CRLS1Q9UJA2 301 aa27.37■■□□□ 1.97
UBP1-201ENST00000283628 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms