RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 LAMA3Q16787 3333 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 TRIM64BA6NI03 449 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 SOCS5O75159 536 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 ARHGEF15O94989 841 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 KRT6AP02538 564 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 KRT6BP04259 564 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 ANXA5P08758 320 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 SHMT2P34897 504 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 KRT6CP48668 564 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 MYBPC3Q14896 1274 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 CDKN3Q16667 212 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 TCTN1Q2MV58 587 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 KLHL35Q6PF15 583 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 APCDD1Q8J025 514 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF555Q8NEP9 628 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 OR13F1Q8NGS4 319 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 BHMTQ93088 406 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 ACDQ96AP0 544 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 TBCDQ9BTW9 1192 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 OSBPL10Q9BXB5 764 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 VN1R3Q9BXE9 311 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 A0A1W2PPW3 197 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 C16orf96A6NNT2 1141 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 B4GAT1O43505 415 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 CLDN9O95484 217 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 RETP07949 1114 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 CSNK1DP48730 415 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 TMED1Q13445 227 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 TUBA3CQ13748 450 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 CHRNA6Q15825 494 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 SUSD1Q6UWL2 747 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 MSRB3Q8IXL7 192 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 NXPE1Q8N323 547 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 FNDC8Q8TC99 324 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 PXYLP1Q8TE99 480 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 IGSF21Q96ID5 467 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 FAM118AQ9NWS6 357 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 ABCB7O75027 752 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 ERN1O75460 977 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 CBSLP0DN79 551 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 CBSP35520 551 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 NSG1P42857 185 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 LBX1P52954 281 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 TMBIM6P55061 237 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 PPP2R2BQ00005 443 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 C16orf72Q14CZ0 275 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 NKG7Q16617 165 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 FGD3Q5JSP0 725 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 ATG9BQ674R7 924 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 GCNT7Q6ZNI0 430 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 ADHFE1Q8IWW8 467 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 MICU2Q8IYU8 434 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 PARVBQ9HBI1 364 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 USE1Q9NZ43 259 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 SH3PXD2BA1X283 911 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 PRKD3O94806 890 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 BCKDHAP12694 445 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 CRHBPP24387 322 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 GKP32189 559 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 RPIAP49247 311 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 TTC23LQ6PF05 361 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 TPGS1Q6ZTW0 290 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 GPR149Q86SP6 731 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 EID3Q8N140 333 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 PJA1Q8NG27 643 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 MIPOL1Q8TD10 442 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 NCLNQ969V3 563 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 HSPBAP1Q96EW2 488 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 SLC22A12Q96S37 553 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 SLC32A1Q9H598 525 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 MAGIXQ9H6Y5 334 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 SMURF2Q9HAU4 748 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 FANCEQ9HB96 536 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 KCTD5Q9NXV2 234 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 AGAP14A8MT82 685 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 GFRA2O00451 464 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 PITPNM1O00562 1244 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD3-201ENST00000249440 GREM1O60565 184 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms