RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000228918.8

LTBR-201, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTBR, Length 2,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-201ENST00000228918 TM6SF2Q9BZW4 377 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ADNPQ9H2P0 1102 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TBC1D23Q9NUY8 699 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 LRFN2Q9ULH4 789 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TET1Q8NFU7 2136 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 MANBAO00462 879 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 NOBOXO60393 691 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 PRKD3O94806 890 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 PORP16435 677 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 GSTM2P28161 218 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 CSKP41240 450 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 MAPK10P53779 464 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 GPNMBQ14956 572 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 GPRC6AQ5T6X5 926 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 GPR149Q86SP6 731 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 NPAS4Q8IUM7 802 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 PLPP6Q8IY26 295 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ZNF555Q8NEP9 628 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 OR6K2Q8NGY2 324 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 USP7Q93009 1102 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 NRBF2Q96F24 287 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 LHPPQ9H008 270 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 LTB4R2Q9NPC1 389 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 IL26Q9NPH9 171 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 INVSQ9Y283 1065 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 AP3M1Q9Y2T2 418 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 FAM220BPB1ANY3 271 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 LOC730098B7Z3J9 87 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 K7ERQ8 282 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SEC22BO75396 215 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TRBC1P01850 177 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 RETP07949 1114 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SELPP16109 830 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 GABARAPL2P60520 117 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 PLD1Q13393 1074 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 PON2Q15165 354 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SGO1Q5FBB7 561 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 C6orf141Q5SZD1 244 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ANKRD34AQ69YU3 496 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SPESP1Q6UW49 350 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SPARTQ8N0X7 666 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 WFDC5Q8TCV5 224 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 RAB2BQ8WUD1 216 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ALG14Q96F25 216 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 MAGED4Q96JG8 741 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 RDH14Q9HBH5 336 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 GNGT2O14610 69 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 AREL1O15033 823 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 HTR1AP08908 422 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 UGT1A1P22309 533 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 UGT1A4P22310 534 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 UGT1A3P35503 534 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 UGT1A5P35504 534 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 KCNAB2Q13303 367 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ATG9BQ674R7 924 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 MACC1Q6ZN28 852 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 PHACTR4Q8IZ21 702 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 DCAF4L2Q8NA75 395 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 OR52E6Q96RD3 313 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 C19orf43Q9BQ61 176 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 MAGIXQ9H6Y5 334 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 INIPQ9NRY2 104 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SLC6A13Q9NSD5 602 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 C1orf109Q9NX04 203 aa15.92■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 A0A1W2PQY0 241 aa15.91■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 C16orf96A6NNT2 1141 aa15.91■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TBKBP1A7MCY6 615 aa15.91■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 BCKDHAP12694 445 aa15.91■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 EPB42P16452 691 aa15.91■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TM4SF4P48230 202 aa15.91■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 MOGQ16653 247 aa15.91■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 CDKN3Q16667 212 aa15.91■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 MEP1AQ16819 746 aa15.91■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 GCNT7Q6ZNI0 430 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms