RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636966.1

CACNA1A-232, Transcript of calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA1A, Length 3,938 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1A-232ENST00000636966 EML5Q05BV3 1969 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 ZNF195O14628 629 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 SGTAO43765 313 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 C6P13671 934 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 VIPR1P32241 457 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 CPOXP36551 454 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 THOP1P52888 689 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 ADPRHP54922 357 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 CLCQ05315 142 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 DMWDQ09019 674 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 MTAPQ13126 283 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 PPP1R3AQ16821 1122 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 TLDC1Q6P9B6 456 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 XKR5Q6UX68 686 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 FAM124AQ86V42 546 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 LSMEM2Q8N112 164 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 FAM156AQ8NDB6 213 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 PJA1Q8NG27 643 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 HCAR2Q8TDS4 363 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 TWIST2Q8WVJ9 160 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 GPR78Q96P69 363 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 HHIPQ96QV1 700 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 TRIM15Q9C019 465 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 TBC1D17Q9HA65 648 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 TIMM22Q9Y584 194 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 LAMA5O15230 3695 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 IGLON5A6NGN9 336 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 RAD51BO15315 384 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 NRP2O60462 931 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 KATNA1O75449 491 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 CD1DP15813 335 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 TPMTP51580 245 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 BLMHQ13867 455 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 IMPG1Q17R60 797 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 CTSL3PQ5NE16 218 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 ZNF678Q5SXM1 525 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 ZFP1Q6P2D0 407 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 CPNE9Q8IYJ1 553 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 GPR150Q8NGU9 434 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 LPGAT1Q92604 370 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 KLK6Q92876 244 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 LGR4Q9BXB1 951 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 WWOXQ9NZC7 414 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 NDUFAF1Q9Y375 327 aa8.05□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 CDC7O00311 574 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 TRIM38O00635 465 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 WNT9AO14904 365 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 PIP5K1BO14986 540 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 SBK3P0C264 359 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 FDXRP22570 491 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 CCNG1P51959 295 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 MTTPP55157 894 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 LCP2Q13094 533 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 HERC3Q15034 1050 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 SGO1Q5FBB7 561 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 PAOXQ6QHF9 649 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 CDYL2Q8N8U2 506 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 METTL6Q8TCB7 284 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 RLN3Q8WXF3 142 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 SPAG4Q9NPE6 437 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 TRPM6Q9BX84 2022 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 C9JVG2 144 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 AKAP10O43572 662 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 FUCA1P04066 466 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 PEX2P28328 305 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 AKT1P31749 480 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 CREB5Q02930 508 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 PRKCQQ04759 706 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 TRIM74Q86UV6 250 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 PQLC1Q8N2U9 271 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 HMGB4Q8WW32 186 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 NRG4Q8WWG1 115 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 PTERQ96BW5 349 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 ZBTB18Q99592 522 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 GULP1Q9UBP9 304 aa8.04□□□□□ -1.12
CACNA1A-232ENST00000636966 IKZF3Q9UKT9 509 aa8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.5 ms