RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CDYLQ9Y232 598 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP99D6REC4 459 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 CD63P08962 238 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 PRLHRP49683 370 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 UBASH3AP57075 661 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXL2P58012 376 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 DCDP81605 110 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKG2Q13237 762 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 TFDP2Q14188 446 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC18A3Q16572 532 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 CRB2Q5IJ48 1285 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF449Q6P9G9 518 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2Y1Q8NGV0 311 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35G2Q8TBE7 412 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 GBP5Q96PP8 586 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 COG4Q9H9E3 785 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 SGTAO43765 313 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CST8O60676 142 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 SPESP1Q6UW49 350 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 PROKR1Q8TCW9 393 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 PTERQ96BW5 349 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ULK4Q96C45 1275 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 COPS8Q99627 209 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 MVB12BQ9H7P6 319 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 SPTBP11277 2137 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 AGTP01019 485 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 GYPCP04921 128 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 HIF1AQ16665 826 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC38Q5VT99 294 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 RHBDD2Q6NTF9 364 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 HAUS1Q96CS2 278 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 AP1M1Q9BXS5 423 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM96AQ9H5X1 160 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM60AQ9NP50 221 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ENTPD4Q9Y227 616 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 HYOU1Q9Y4L1 999 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CSAG2Q9Y5P2 127 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGALP20701 1170 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP25P42331 645 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 TMPRSS15P98073 1019 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 IQCB1Q15051 598 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNMB4Q86W47 210 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 P3H4Q92791 437 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CNDP1Q96KN2 507 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 VAT1Q99536 393 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52A5Q9H2C5 316 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS37BQ9H9H4 285 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 PRF1P14222 555 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 GEMP55040 296 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 APOL2Q9BQE5 337 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 SPOPO43791 374 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ZG16O60844 167 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 UGT2B7P16662 529 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 PDHA2P29803 388 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CDKN2BP42772 138 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 NXPE1Q8N323 547 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 OR13C4Q8NGS5 318 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJB14Q8TBM8 379 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 GRHL3Q8TE85 626 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP4R1Q8TF05 950 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 HEXDCQ8WVB3 486 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXL4Q9UKA2 621 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 C5orf60A6NFR6 353 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS44E7EML9 344 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 AGPSO00116 658 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 AKR1B10O60218 316 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ALOX12BO75342 701 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 UMODP07911 640 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CD151P48509 253 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 SOX8P57073 446 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 XIAPP98170 497 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC16Q13042 620 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 RHOT2Q8IXI1 618 aa26.4■■□□□ 1.82
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