RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 OR4C6Q8NH72 309 aa11.23□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 OR5K2Q8NHB8 316 aa11.23□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.23□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 ZFPM2Q8WW38 1151 aa11.23□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 APOPT1Q96IL0 206 aa11.23□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 TSNARE1Q96NA8 513 aa11.23□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 SLC12A9Q9BXP2 914 aa11.23□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 MVB12BQ9H7P6 319 aa11.23□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 RDH14Q9HBH5 336 aa11.23□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 PARD6AQ9NPB6 346 aa11.23□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 PSMD13Q9UNM6 376 aa11.23□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 DOLKQ9UPQ8 538 aa11.23□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 BTN3A1O00481 513 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 COPEO14579 308 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 ZBTB14O43829 449 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 TYROBPO43914 113 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 NOBOXO60393 691 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 C1orf105O95561 183 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 CATP04040 527 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 RBP1P09455 135 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 ALPPL2P10696 532 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 GMPRP36959 345 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 SLC19A1P41440 591 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 FASLGP48023 281 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 SLC18A1P54219 525 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 ABRQ12979 859 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 TCEA2Q15560 299 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 PPP1R3AQ16821 1122 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 DEFB133Q30KQ1 61 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 TTMPQ5BVD1 217 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 CDKL4Q5MAI5 379 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 SBSNQ6UWP8 590 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 PRR23CQ6ZRP0 262 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 SPATA6LQ8N4H0 392 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 TMEM151AQ8N4L1 468 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 OR2I1PQ8NGU4 316 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 STAG3L4Q8TBR4 150 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 MAGEC3Q8TD91 643 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 DLG3Q92796 817 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 PTERQ96BW5 349 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 C12orf66Q96MD2 445 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 PARVBQ9HBI1 364 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 MED4Q9NPJ6 270 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 POT1Q9NUX5 634 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 ZNF358Q9NW07 568 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 POLG2Q9UHN1 485 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 IKZF3Q9UKT9 509 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 GRID1Q9ULK0 1009 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 ASF1AQ9Y294 204 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 OARD1Q9Y530 152 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 FAM186AA6NE01 2351 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 OR52A4PA6NMU1 304 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 ARHGEF33A8MVX0 844 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 TARM1B6A8C7 271 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 CDC7O00311 574 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 KERAO60938 352 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 CREB1P16220 341 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 TFEBP19484 476 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 CYP2A7P20853 494 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 AP1S2P56377 157 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 CDKL1Q00532 357 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 IL9RQ01113 521 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 GPS2Q13227 327 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 OR4D1Q15615 310 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 TSNQ15631 228 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 CCDC153Q494R4 210 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 C14orf28Q4W4Y0 310 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 TECRLQ5HYJ1 363 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 SLC9B2Q86UD5 537 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 GATAD2AQ86YP4 633 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 ARL10Q8N8L6 244 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 MAPK15Q8TD08 544 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 MCOLN3Q8TDD5 553 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 SLC37A2Q8TED4 501 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 RAD51AP1Q96B01 352 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 ZBTB9Q96C00 473 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-211ENST00000582232 ATOH8Q96SQ7 321 aa11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms