RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562638.5

TCF4-215, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 1 (best)

Gene TCF4, Length 401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-215	ENST00000562638	MEIOB	Q8N635	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	EMC1	Q8N766	993 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	STAM	Q92783	540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	OTUB2	Q96DC9	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	TXN2	Q99757	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	DERL2	Q9GZP9	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	RNF32	Q9H0A6	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	ASB8	Q9H765	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	ZNF639	Q9UID6	485 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638		U3KQ87	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638		A0A0B4J293	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638		A0A1W2PN81	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	KRT87P	A6NCN2	255 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	SULT1C2	O00338	296 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	PIK3R2	O00459	728 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	UBE2C	O00762	179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	ADAM12	O43184	909 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	AKR7A2	O43488	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	PRKAB2	O43741	272 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	KERA	O60938	352 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	EFCAB14	O75071	495 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	VPS4B	O75351	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	ENTPD3	O75355	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	RECQL4	O94761	1208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	PDE8B	O95263	885 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	TTC4	O95801	387 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	AHSG	P02765	367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	FTH1	P02794	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	PGR	P06401	933 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	TPO	P07202	933 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	SLC10A3	P09131	477 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	CD3G	P09693	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	SBK2	P0C263	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	PRPS1L1	P21108	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	CPN2	P22792	545 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	ATP2B4	P23634	1241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	ACVR2A	P27037	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	G0S2	P27469	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	EPHA3	P29320	983 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	SLC7A1	P30825	629 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	RYK	P34925	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	CHRNA7	P36544	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	GMPR	P36959	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-215	ENST00000562638	RFC3	P40938	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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