RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561395.5

TPM1-231, Transcript of tropomyosin 1, human

TSL 5

Gene TPM1, Length 673 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPM1-231	ENST00000561395	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	EBF1	Q9UH73	591 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TMCO1	Q9UM00	188 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SPTA1	P02549	2419 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395		A0A1W2PP55	124 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395		K7ESM1	405 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	QSOX1	O00391	747 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF195	O14628	629 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	STX16	O14662	325 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	KLK8	O60259	260 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	UBOX5	O94941	541 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	FTH1	P02794	183 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	HOXB2	P14652	356 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CCR7	P32248	378 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	HK3	P52790	923 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SETDB1	Q15047	1291 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	AGER	Q15109	404 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PFKFB4	Q16877	469 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	UNC50	Q53HI1	259 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SBSN	Q6UWP8	590 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	STON2	Q8WXE9	905 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ERP27	Q96DN0	273 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	WWP1	Q9H0M0	922 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	HEY2	Q9UBP5	337 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	OARD1	Q9Y530	152 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ATM	Q13315	3056 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	IGLON5	A6NGN9	336 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	MATN2	O00339	956 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	KPNA5	O15131	536 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	INPP4B	O15327	924 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	NUAK1	O60285	661 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SNX2	O60749	519 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	DNTT	P04053	509 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	MPC1L	P0DKB6	136 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SERPINB3	P29508	390 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	GPR1	P46091	355 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PRLHR	P49683	370 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CTSC	P53634	463 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	NAA20	P61599	178 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ZBTB16	Q05516	673 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TUBB3	Q13509	450 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TGFBI	Q15582	683 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	BCL7A	Q4VC05	210 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ANO7	Q6IWH7	933 aa		7.36	□□□□□ -1.23

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