RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 EFCAB7A8K855 629 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 C2orf74A8MZ97 194 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 E7ESA3 106 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 VPS26AO75436 327 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 S1PR4O95977 384 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 GSTA2P09210 222 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CTAGE8P0CG41 777 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CBSLP0DN79 551 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ITGB6P18564 788 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ACADLP28330 430 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CBSP35520 551 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC1A2P43004 574 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CFHR1Q03591 330 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 DUPD1Q68J44 220 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 NEK10Q6ZWH5 1172 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CTAGE6Q86UF2 777 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CTAGE4Q8IX94 777 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ZBTB2Q8N680 514 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CEP112Q8N8E3 955 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 OR52E1Q8NGJ3 308 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 PYROXD1Q8WU10 500 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CDKL2Q92772 493 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 RAD51AP1Q96B01 352 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC22A18Q96BI1 424 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 BIRC8Q96P09 236 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 DPH5Q9H2P9 285 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SYTL2Q9HCH5 934 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM114A2Q9NRY5 505 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC39A1Q9NY26 324 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 OGFRQ9NZT2 677 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ZFATQ9P243 1243 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 KLHL3Q9UH77 587 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CHMP2BQ9UQN3 213 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 URB1O60287 2271 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 FREM2Q5SZK8 3169 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A087WV48 116 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 OR6C74A6NCV1 312 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF839A8K0R7 811 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 A8MU76 341 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 FKBP9O95302 570 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCG1P45844 678 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 MC2RQ01718 297 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ACY1Q03154 408 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 IL11RAQ14626 422 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CTSL3PQ5NE16 218 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 STEAP4Q687X5 459 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 XKR5Q6UX68 686 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 PALM2Q8IXS6 379 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ZBED8Q8IZ13 594 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 KRT222Q8N1A0 295 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 OR4E2Q8NGC2 313 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CFAP36Q96G28 342 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 HGH1Q9BTY7 390 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 FANCEQ9HB96 536 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 PDE7BQ9NP56 450 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 C1GALT1Q9NS00 363 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TAS2R13Q9NYV9 303 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM9Q9P0T7 183 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC39A10Q9ULF5 831 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 RAXQ9Y2V3 346 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 GSAPA4D1B5 854 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 STMND1H3BQB6 276 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 LIPCP11150 499 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CDH3P22223 829 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 MPSTP25325 297 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC5A2P31639 672 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 RGS4P49798 205 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP1A2P50993 1020 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 RAB28P51157 221 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 GFERP55789 205 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 HSD11B2P80365 405 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 CTBP1Q13363 440 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 NAA25Q14CX7 972 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 MSS51Q4VC12 460 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 UNC5AQ6ZN44 842 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM92BQ6ZTR7 304 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC26A11Q86WA9 606 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 DENND6AQ8IWF6 608 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 FBXO36Q8NEA4 188 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 OR5AR1Q8NGP9 310 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGGTA-205ENST00000558534 OR8K5Q8NH50 307 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms