RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 GRID2O43424 1007 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 GPC4O75487 556 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 S100BP04271 92 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 FUT4P22083 530 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 PTPN4P29074 926 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 AGTR2P50052 363 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 IDH3AP50213 366 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 RPL14P50914 215 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 TPMTP51580 245 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 TUBB3Q13509 450 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 INPP5AQ14642 412 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 VRK3Q8IV63 474 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 PYDC1Q8WXC3 89 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 ESAMQ96AP7 390 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 TMEM159Q96B96 161 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 SKA1Q96BD8 255 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 WDR26Q9H7D7 661 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 COG4Q9H9E3 785 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 CD93Q9NPY3 652 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 WNT16Q9UBV4 365 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 OARD1Q9Y530 152 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 MATN2O00339 956 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 FFAR2O15552 330 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 LYNP07948 512 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 MPC1LP0DKB6 136 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 VCLP18206 1134 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 TEAD1P28347 426 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 DGKEP52429 567 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 INHBCP55103 352 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 SLC34A1Q06495 639 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 PHKG1Q16816 387 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 ANKS6Q68DC2 871 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 DOK6Q6PKX4 331 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 SPATA24Q86W54 205 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 PGBD3Q8N328 593 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 SHDQ96IW2 340 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 WWP1Q9H0M0 922 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 CDYLQ9Y232 598 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 ASB1Q9Y576 335 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 KRBA1A5PL33 1030 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 LILRB5O75023 590 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 SLCO2B1O94956 709 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 GUCA1CO95843 209 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 JUNP05412 331 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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THBS3-210ENST00000541576 PPP2CAP67775 309 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 LPCAT4Q643R3 524 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 NEK10Q6ZWH5 1172 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 SYT13Q7L8C5 426 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 CLNKQ7Z7G1 428 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 CUZD1Q86UP6 607 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 SATL1Q86VE3 508 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 RILPQ96NA2 401 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 LGR4Q9BXB1 951 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 TEX101Q9BY14 249 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 NMUR2Q9GZQ4 415 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 VCX3BQ9H321 246 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 LTB4R2Q9NPC1 389 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 GPR34Q9UPC5 381 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 OR1A2Q9Y585 309 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 AK5Q9Y6K8 562 aa8.5□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 C8GP07360 202 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 RPS17P08708 135 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 ACSL1P33121 698 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 TRIM23P36406 574 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 HK2P52789 917 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 NAA20P61599 178 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 EPGNQ6UW88 154 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 ZNF547Q8IVP9 402 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 ARL10Q8N8L6 244 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 PDPRQ8NCN5 879 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 ASB11Q8WXH4 323 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 GLMNQ92990 594 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 FAM210AQ96ND0 272 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 ASB2Q96Q27 587 aa8.49□□□□□ -1.05
THBS3-210ENST00000541576 EGFL8Q99944 293 aa8.49□□□□□ -1.05
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