RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 PCDHGA12O60330 932 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 OR4F21O95013 312 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CBX6O95503 412 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SLC10A7Q0GE19 358 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 BST1Q10588 318 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ZCWPW2Q504Y3 356 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 IL23RQ5VWK5 629 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ERICH5Q6P6B1 374 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RABEPKQ7Z6M1 372 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PIH1D2Q8WWB5 315 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 DLG3Q92796 817 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PGM2Q96G03 612 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 WDR92Q96MX6 357 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 DCLRE1BQ9H816 532 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RASSF1Q9NS23 344 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 MAFFQ9ULX9 164 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CFL2Q9Y281 166 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RCCD1A6NED2 376 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 BBIP1A8MTZ0 92 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CDC7O00311 574 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SCDO00767 359 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 GJB5O95377 273 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF823P16415 610 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 BMP6P22004 513 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 TRAF3Q13114 568 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ELOA3BQ3SY89 546 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 GK5Q6ZS86 529 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 AMIGO1Q86WK6 493 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SLC22A15Q8IZD6 547 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ELOA3Q8NG57 546 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 TTYH3Q9C0H2 523 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 L2HGDHQ9H9P8 463 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 C2orf78A6NCI8 922 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 TSC22D2O75157 780 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 COQ9O75208 318 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CYB5AP00167 134 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CYP4B1P13584 511 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CHRNB2P17787 502 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 FBLP22087 321 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CRHR1P34998 444 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RCVRNP35243 200 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CCR10P46092 362 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 USP46P62068 366 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SLC25A3Q00325 362 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CCNIQ14094 377 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF805Q5CZA5 627 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 BROXQ5VW32 411 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 KIAA0408Q6ZU52 694 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 DCAF4L2Q8NA75 395 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PIGXQ8TBF5 258 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 OR2M4Q96R27 311 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 FUT8Q9BYC5 575 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1W2PPM1 405 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 C2P06681 752 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ZCCHC18P0CG32 403 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 IL7RP16871 459 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 GKP32189 559 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 VIPR2P41587 438 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 DHCR24Q15392 516 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 DPYSL2Q16555 572 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PPM1JQ5JR12 505 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RALGPS1Q5JS13 557 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 C12orf40Q86WS4 652 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 NPAS2Q99743 824 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 OR51F1A6NGY5 319 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 LMAN2Q12907 356 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 C1orf61Q13536 156 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 KBTBD6Q86V97 674 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 MPP5Q8N3R9 675 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ANKRD7Q92527 254 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RCN3Q96D15 328 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 FCRL5Q96RD9 977 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SMOQ99835 787 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM248Q9NWD8 314 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PDP2Q9P2J9 529 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ERGIC3Q9Y282 383 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms