RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CHD4	Q14839	1912 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908		A6NCN8	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	YDJC	A8MPS7	323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908		A8MZ25	164 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	VILL	O15195	856 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	MID1	O15344	667 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	KCNN4	O15554	427 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CYTH3	O43739	400 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	ECE2	O60344	883 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC192	P0DO97	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SCG2	P13521	617 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	DPEP1	P16444	411 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	ALOX12	P18054	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	ITGB6	P18564	788 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PSMB10	P40306	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	UBA7	P41226	1012 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CAMP	P49913	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	NDUFA8	P51970	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TERF1	P54274	439 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	GAS1	P54826	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	STK38	Q15208	465 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SLX4	Q8IY92	1834 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908		A0A1B0GVL5	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	OGG1	O15527	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	DOK2	O60496	412 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TMCC2	O75069	709 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	ENTPD3	O75355	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CAVIN2	O95810	425 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CALML3	P27482	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	MAPK4	P31152	587 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	NLRP5	P59047	1200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SREBF2	Q12772	1141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CDC16	Q13042	620 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	COASY	Q13057	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	RESP18	Q5W5W9	173 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	HM13	Q8TCT9	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	IL17F	Q96PD4	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SEMA3C	Q99985	751 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms