RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517052.1

RNU6-448P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 448, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-448P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-448P-201ENST00000517052 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 KCNE2Q9Y6J6 123 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 A0A1W2PPH5 198 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 A6NLC8 198 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 C15orf61A6NNL5 157 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 SCAMP1O15126 338 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 NDUFS4O43181 175 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 IDH3BO43837 385 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 MAGEC1O60732 1142 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PEX14O75381 377 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 DFFBO76075 338 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 C22orf31O95567 290 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 GH2P01242 217 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 CLEC3BP05452 202 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 SPARCP09486 303 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGHV4-31P0DP07 118 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 ACTN1P12814 892 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 ITIH1P19827 911 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 CA6P23280 308 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 NMBRP28336 390 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 BSGP35613 385 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 MMP12P39900 470 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 MAPK9P45984 424 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 CASP6P55212 293 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PAX9P55771 341 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 HUNKP57058 714 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 HERV-K104P61576 105 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PPP2R2BQ00005 443 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PLA2G7Q13093 441 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 CALCOCO2Q13137 446 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 BIRC3Q13489 604 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 MED22Q15528 200 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 TAF13Q15543 124 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 RNF212Q495C1 297 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 XKR3Q5GH77 459 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 MDH1BQ5I0G3 518 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 WLSQ5T9L3 541 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 GRTP1Q5TC63 336 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 ACSM2BQ68CK6 577 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 ADALQ6DHV7 355 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM166AQ6J272 317 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 NCEH1Q6PIU2 408 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 BTN2A1Q7KYR7 527 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 KIRREL3Q8IZU9 778 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 POM121L12Q8N7R1 296 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 Q8NBF4 154 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR10G8Q8NGN5 311 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR13J1Q8NGT2 312 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF519Q8TB69 540 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 ETNPPLQ8TBG4 499 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 TBC1D16Q8TBP0 767 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 MIPOL1Q8TD10 442 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 KCNG4Q8TDN1 519 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 RNF128Q8TEB7 428 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 ARHGAP45Q92619 1136 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 RFT1Q96AA3 541 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 ELMOD3Q96FG2 381 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM81BQ96LP2 452 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 C1orf74Q96LT6 269 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 NUDCD1Q96RS6 583 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 GAD1Q99259 594 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 DDOQ99489 341 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 DGCR6LQ9BY27 220 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 LCE3DQ9BYE3 92 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PITPNM3Q9BZ71 974 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 VN1R1Q9GZP7 353 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 KAT14Q9H8E8 782 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PANK3Q9H999 370 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 GNB4Q9HAV0 340 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 HHATLQ9HCP6 504 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PREBQ9HCU5 417 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 SPHK2Q9NRA0 654 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 LUZP4Q9P127 313 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 PDP2Q9P2J9 529 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 RHCGQ9UBD6 479 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-448P-201ENST00000517052 MUTYHQ9UIF7 546 aa0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms