RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	CD86	P42081	329 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	D2HGDH	Q8N465	521 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNY	Q8ND76	341 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR26	Q8NDV2	337 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TLR10	Q9BXR5	811 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	DTL	Q9NZJ0	730 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	AMACR	Q9UHK6	382 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5K3	A6NET4	321 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	LGALS16	A8MUM7	142 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS44	E7EML9	344 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TCF4	P15884	667 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	GJC1	P36383	396 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	DCDC1	P59894	354 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNT2	Q10471	571 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKAA1	Q13131	559 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK5R2	Q13319	367 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	LAMB3	Q13751	1172 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT33B	Q14525	404 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	AMZ2	Q86W34	360 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB2	Q8N680	514 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR150	Q8NGU9	434 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TEKT4	Q8WW24	435 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	MAML1	Q92585	1016 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	LRFN5	Q96NI6	719 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	RANBP9	Q96S59	729 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	FANCL	Q9NW38	375 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6C74	A6NCV1	312 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	LDB2	O43679	373 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNJ13	O60928	360 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	WNT11	O96014	354 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHE	P01854	428 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	MYBL1	P10243	752 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PRF1	P14222	555 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	AGXT	P21549	392 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH3	P22223	829 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNC	P24863	283 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ADCY2	Q08462	1091 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	IHH	Q14623	411 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	NCF4	Q15080	339 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ASIC2	Q16515	512 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	RPE65	Q16518	533 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	MSMP	Q1L6U9	139 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	LCN10	Q6JVE6	187 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	IP6K3	Q96PC2	410 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF711	Q9Y462	761 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	POLQ	O75417	2590 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	GSAP	A4D1B5	854 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ZG16	O60844	167 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	LCA5L	O95447	670 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	BPI	P17213	487 aa		10.52	□□□□□ -0.73

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