RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 A8MT66 165 aa21.51■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 MTHFD2P13995 350 aa21.51■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 NME1P15531 152 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 KRT33BQ14525 404 aa21.51■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 PDK4Q16654 411 aa21.51■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 UAP1L1Q3KQV9 507 aa21.51■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 LIPMQ5VYY2 423 aa21.51■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 PHC3Q8NDX5 983 aa21.51■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 MAGEC3Q8TD91 643 aa21.51■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 GPBAR1Q8TDU6 330 aa21.51■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 RMDN2Q96LZ7 410 aa21.51■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 MAGEB18Q96M61 343 aa21.51■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 MANSC1Q9H8J5 431 aa21.51■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 RDH14Q9HBH5 336 aa21.51■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 TMCO1Q9UM00 188 aa21.51■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 ARHGEF33A8MVX0 844 aa21.5■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 C1orf105O95561 183 aa21.5■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 RPN2P04844 631 aa21.5■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 BDKRB1P46663 353 aa21.5■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 GNGT1P63211 74 aa21.5■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 ELOCQ15369 112 aa21.5■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 UNC5DQ6UXZ4 953 aa21.5■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa21.5■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 NRROSQ86YC3 692 aa21.5■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 SIRPGQ9P1W8 387 aa21.5■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 DOLKQ9UPQ8 538 aa21.5■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 SPAG17Q6Q759 2223 aa21.5■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 PRR19A6NJB7 356 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 CFIP05156 583 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 ANXA5P08758 320 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 DPP6P42658 865 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 CLCA4Q14CN2 919 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 TUBB8Q3ZCM7 444 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 CFAP157Q5JU67 520 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 CCNYL1Q8N7R7 359 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 LMX1AQ8TE12 382 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 FERD3LQ96RJ6 166 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 LRRC61Q9BV99 259 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 SPASTQ9UBP0 616 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 SNX11Q9Y5W9 270 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 PRKAA2P54646 552 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 NAGLUP54802 743 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 AP1S2P56377 157 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 DUOXA1Q1HG43 343 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 KIF19Q2TAC6 998 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 FBXO48Q5FWF7 155 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 ATG16L1Q676U5 607 aa21.49■■□□□ 1.03
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PSPC1-204ENST00000492741 R4GN57 208 aa21.49■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 OR52A4PA6NMU1 304 aa21.48■■□□□ 1.03
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PSPC1-204ENST00000492741 PRKG2Q13237 762 aa21.48■■□□□ 1.03
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PSPC1-204ENST00000492741 SULT1C3Q6IMI6 304 aa21.48■■□□□ 1.03
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PSPC1-204ENST00000492741 RABEPKQ7Z6M1 372 aa21.48■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 CEP76Q8TAP6 659 aa21.48■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 WASH6PQ9NQA3 447 aa21.48■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 WWOXQ9NZC7 414 aa21.48■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 LRP4O75096 1905 aa21.47■■□□□ 1.03
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PSPC1-204ENST00000492741 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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PSPC1-204ENST00000492741 HOXD12P35452 270 aa21.47■■□□□ 1.03
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PSPC1-204ENST00000492741 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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PSPC1-204ENST00000492741 OR5K2Q8NHB8 316 aa21.47■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 PPP4R1Q8TF05 950 aa21.47■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC138Q96M89 665 aa21.47■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa21.47■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 ACSS2Q9NR19 701 aa21.47■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PSPC1-204ENST00000492741 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa21.47■■□□□ 1.03
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