RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGEF7Q14155 803 aa6.32□□□□□ -1.4
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PRPF40A-210ENST00000489741 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 IL17BQ9UHF5 180 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 NBASA2RRP1 2371 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A0U1RQS6 177 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1W2PRX2 142 aa6.3□□□□□ -1.4
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