RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 LDB2O43679 373 aa12.27□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
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PRAME-212ENST00000485532 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
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PRAME-212ENST00000485532 SERPINA9Q86WD7 417 aa12.26□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
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PRAME-212ENST00000485532 CLDN19Q8N6F1 224 aa12.26□□□□□ -0.45
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PRAME-212ENST00000485532 OR52A5Q9H2C5 316 aa12.26□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 SRMSQ9H3Y6 488 aa12.26□□□□□ -0.45
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PRAME-212ENST00000485532 BTRCQ9Y297 605 aa12.26□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa12.26□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 FER1L5A0AVI2 2057 aa12.26□□□□□ -0.45
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PRAME-212ENST00000485532 MEN1O00255 615 aa12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 RAD51CO43502 376 aa12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 STK10O94804 968 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 METTL18O95568 372 aa12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 CAPN1P07384 714 aa12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 ATXN8OSP0DMR3 200 aa12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 RALBP11234 206 aa12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 ITGALP20701 1170 aa12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 ACRV1P26436 265 aa12.25□□□□□ -0.45
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PRAME-212ENST00000485532 PRKAA1Q13131 559 aa12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 PTCHD3Q3KNS1 767 aa12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 NADK2Q4G0N4 442 aa12.25□□□□□ -0.45
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PRAME-212ENST00000485532 KCTD11Q693B1 232 aa12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 NAPRTQ6XQN6 538 aa12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 TAS2R42Q7RTR8 314 aa12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 PIANPQ8IYJ0 282 aa12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 DSELQ8IZU8 1212 aa12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 FAM71DQ8N9W8 422 aa12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 OR52E1Q8NGJ3 308 aa12.25□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 SLCO2A1Q92959 643 aa12.25□□□□□ -0.45
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