RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR78Q96P69 363 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ALG9Q9H6U8 611 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 RDH14Q9HBH5 336 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PARVBQ9HBI1 364 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 POT1Q9NUX5 634 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM216Q9P0N5 145 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 POLG2Q9UHN1 485 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF112Q9ULX5 631 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TMCO1Q9UM00 188 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR37Q9Y2I8 494 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 OARD1Q9Y530 152 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR179Q6PRD1 2367 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PROB1E7EW31 1015 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CDC7O00311 574 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 C1orf105O95561 183 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 VIPP01282 170 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TPBGLP0DKB5 382 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CREB1P16220 341 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 HPDP32754 393 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 GMPRP36959 345 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 GLRBP48167 497 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 RPIAP49247 311 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CDKL1Q00532 357 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CSRP2Q16527 193 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFB133Q30KQ1 61 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 INAVAQ3KP66 663 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TECRLQ5HYJ1 363 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 OGFOD3Q6PK18 319 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 RASGRP3Q8IV61 690 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A45Q8N413 288 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SFRP1Q8N474 314 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB42Q8N4Z0 105 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC63Q8NA47 563 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PHC3Q8NDX5 983 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5K2Q8NHB8 316 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 RDH11Q8TC12 318 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 MAPK15Q8TD08 544 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TCP10LQ8TDR4 215 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SAP25Q8TEE9 199 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 RAD51AP1Q96B01 352 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PTERQ96BW5 349 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC138Q96M89 665 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SELENOSQ9BQE4 189 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SMOC1Q9H4F8 434 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 IL21RQ9HBE5 538 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF358Q9NW07 568 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 NLGN3Q9NZ94 848 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 XPR1Q9UBH6 696 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PDE10AQ9Y233 779 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 BPTFQ12830 3046 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM120BA0PK00 339 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 LNP1A1A4G5 178 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF839A8K0R7 811 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGEF33A8MVX0 844 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 B4DGG1 531 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 FFAR2O15552 330 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PLIN3O60664 434 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM24O75264 130 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 EML2O95834 649 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PROCP04070 461 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ANXA5P08758 320 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 NR1D1P20393 614 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 HSD17B2P37059 387 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC19A1P41440 591 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP2R2AP63151 447 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 IL9RQ01113 521 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SPEM2Q0P670 501 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC14A1Q13336 389 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 BIRC2Q13490 618 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TGFBIQ15582 683 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 OR4D1Q15615 310 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP1R3AQ16821 1122 aa9.15□□□□□ -0.94
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