RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454323.1

CUL3-208, Transcript of cullin 3, human

TSL 3

Gene CUL3, Length 688 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUL3-208	ENST00000454323	FASLG	P48023	281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ZNF75D	P51815	510 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ASIC1	P78348	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	CDK3	Q00526	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ID2	Q02363	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	GAD2	Q05329	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	PPAT	Q06203	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	RPA4	Q13156	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	RCN2	Q14257	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SHF	Q7M4L6	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TRIB2	Q92519	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	DNASE1L2	Q92874	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	MUS81	Q96NY9	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SNX7	Q9UNH6	387 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323		A0A1W2PPC1	479 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323		A0A1W2PRV1	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TMEM221	A6NGB7	291 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	T	O15178	435 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SPINT2	O43291	252 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	HSPA12A	O43301	675 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	LDB2	O43679	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ZBTB14	O43829	449 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ITGB8	P26012	769 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	GABRA5	P31644	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	RASSF2	P50749	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SELENOV	P59797	346 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	STX1B	P61266	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	NR1D2	Q14995	579 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	EFNB3	Q15768	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323		Q5PR19	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	DET1	Q7L5Y6	550 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TEX9	Q8N6V9	391 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	EMC1	Q8N766	993 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	FEV	Q99581	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TMEM206	Q9H813	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	DCC	P43146	1447 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	UNC13B	O14795	1591 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ADAM10	O14672	748 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	KCNN4	O15554	427 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SSX4	O60224	188 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms