RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 TTI1O43156 1089 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 MAP3K7O43318 606 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 RAD51CO43502 376 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 SRP72O76094 671 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 PDGFAP04085 211 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 ITGALP20701 1170 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 RRADP55042 308 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 DR1Q01658 176 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 CDH17Q12864 832 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 GPR18Q14330 331 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 CCDC38Q502W7 563 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 LDLRAP1Q5SW96 308 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 GPRC6AQ5T6X5 926 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 KCTD11Q693B1 232 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 TMEM135Q86UB9 458 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 CARFQ8N187 725 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 ZNF398Q8TD17 642 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 GRK7Q8WTQ7 553 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 NAT14Q8WUY8 206 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 RSC1A1Q92681 617 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 SLC41A2Q96JW4 573 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 LRRC1Q9BTT6 524 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 ING2Q9H160 280 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 MLXIPLQ9NP71 852 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 MAP10Q9P2G4 905 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 TLCD2A6NGC4 264 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 ARGFXA6NJG6 315 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 LDB2O43679 373 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 DNAJB5O75953 348 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 RHOXF2BP0C7M4 288 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 MC4RP32245 332 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 CA5AP35218 305 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 RPL22P35268 128 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 HADHAP40939 763 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 PTGIRP43119 386 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 CCL11P51671 97 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 TUBB4BP68371 445 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 HSD11B2P80365 405 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 SLC7A5Q01650 507 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 PLCL1Q15111 1095 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 PPP1R7Q15435 360 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 FNBP1LQ5T0N5 605 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 IZUMO3Q5VZ72 239 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 ARMC6Q6NXE6 501 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 MICALCLQ6ZW33 695 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 TAS2R42Q7RTR8 314 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 TMEM126BQ8IUX1 230 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 MR1Q95460 341 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 PNPLA2Q96AD5 504 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 DCUN1D1Q96GG9 259 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 RHOXF2Q9BQY4 288 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 TRIM51Q9BSJ1 452 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 ARNT2Q9HBZ2 717 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 CASS4Q9NQ75 786 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 FGF21Q9NSA1 209 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 SEMA5BQ9P283 1151 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 PCYOX1Q9UHG3 505 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 SNX7Q9UNH6 387 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 ABCA12Q86UK0 2595 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 KLHL33A6NCF5 533 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 FAM187AA6NFU0 413 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 SEMA7AO75326 666 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 SCRG1O75711 98 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 RAB40ALP0C0E4 278 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 RPL10P27635 214 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 GRIA1P42261 906 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 DRG2P55039 364 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 NADK2Q4G0N4 442 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 TMEM220Q6QAJ8 160 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 MED25Q71SY5 747 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 MAATS1Q7Z4T9 603 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 OOSP2Q86WS3 158 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-210ENST00000442481 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms