RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PARVBQ9HBI1 364 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 HEBP1Q9NRV9 189 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ARL15Q9NXU5 204 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 WWOXQ9NZC7 414 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ARMCX1Q9P291 453 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 OPTCQ9UBM4 332 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PCTPQ9UKL6 214 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 GPR34Q9UPC5 381 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1W2PP55 124 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ANTXRLA6NF34 631 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CAPN14A8MX76 684 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 K7EPI3 171 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MAN2B1O00754 1011 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SDHDO14521 159 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 GYG2O15488 501 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 DCXO43602 365 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SGTAO43765 313 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 GPR37L1O60883 481 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 KATNA1O75449 491 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 STK16O75716 305 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SLCO2B1O94956 709 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 OTCP00480 354 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PCCBP05166 539 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 T-ENOLP0DO92 83 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 UROSP10746 265 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 NQO1P15559 274 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TEAD1P28347 426 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MSX1P28360 303 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 AGTR2P50052 363 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 HNMTP50135 292 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 COPAP53621 1224 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CTSCP53634 463 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MXRA7P84157 204 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ARHGAP8P85298 464 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 GTF2H2Q13888 395 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PHKG1Q16816 387 aa6.49□□□□□ -1.37
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HDAC8-211ENST00000415409 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CLEC6AQ6EIG7 209 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PNCKQ6P2M8 343 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ASRGL1Q7L266 308 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa6.49□□□□□ -1.37
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HDAC8-211ENST00000415409 KBTBD6Q86V97 674 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CACUL1Q86Y37 369 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.49□□□□□ -1.37
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HDAC8-211ENST00000415409 TEX9Q8N6V9 391 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 AGAP11Q8TF27 550 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 UBTD2Q8WUN7 234 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ATL1Q8WXF7 558 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 FAM3CQ92520 227 aa6.49□□□□□ -1.37
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HDAC8-211ENST00000415409 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 C19orf60Q96EN9 201 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF382Q96SR6 550 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 CD244Q9BZW8 370 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 PREBQ9HCU5 417 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-211ENST00000415409 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.49□□□□□ -1.37
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