RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 RPTNQ6XPR3 784 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 XAGE5Q8WWM1 108 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 IQCF5A8MTL0 148 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 NUAK1O60285 661 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CLDN9O95484 217 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 NUDT14O95848 222 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 TGFB3P10600 412 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 UQCRC1P31930 480 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CASP9P55211 416 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 RHBDL3P58872 404 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 UFM1P61960 85 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 NCS1P62166 190 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 C4orf46Q504U0 113 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 FBXO42Q6P3S6 717 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 VSIG10LQ86VR7 867 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 UBE2E3Q969T4 207 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CDK15Q96Q40 435 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 TMEM209Q96SK2 561 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 SGK2Q9HBY8 427 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CPNE5Q9HCH3 593 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 LMTK2Q8IWU2 1503 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 A0A075B6Q4 140 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 RPS14P62263 151 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 FOXM1Q08050 763 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 ATP6AP1Q15904 470 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 KLHL22Q53GT1 634 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 KBTBD6Q86V97 674 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 OR10H4Q8NGA5 316 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 DEDD2Q8WXF8 326 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 RFKQ969G6 155 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 LHPPQ9H008 270 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CD93Q9NPY3 652 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 ALG5Q9Y673 324 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 NID2Q14112 1375 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 MT-ND2P03891 347 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CYP2B6P20813 491 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 PRKCHP24723 683 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 WEE1P30291 646 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 SLC5A2P31639 672 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 HUNKP57058 714 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 ACOX1Q15067 660 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 TSTD2Q5T7W7 516 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CGB2Q6NT52 195 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 RBFAQ8N0V3 343 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CIPCQ9C0C6 399 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CPA4Q9UI42 421 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 COQ9O75208 318 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 PAGE1O75459 146 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 TOXO94900 526 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 IFNGP01579 166 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 F8A1P23610 371 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 GGT5P36269 586 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 ZNF280DQ6N043 979 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 SAMD7Q7Z3H4 446 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 OAFQ86UD1 273 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 GAL3ST1Q99999 423 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 ASPNQ9BXN1 380 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 RHBGQ9H310 441 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 TLE6Q9H808 572 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 SLC39A1Q9NY26 324 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 PSAT1Q9Y617 370 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 FKBP7Q9Y680 259 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 ITSN1Q15811 1721 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms