RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 IRF9Q00978 393 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 SP140Q13342 867 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 TBC1D21Q8IYX1 336 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 PHC3Q8NDX5 983 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 MCOLN3Q8TDD5 553 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 SLC37A2Q8TED4 501 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 SH3KBP1Q96B97 665 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 NXNL1Q96CM4 212 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 HIST1H2AJQ99878 128 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 H2AFJQ9BTM1 129 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 TMBIM4Q9HC24 238 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 RXFP3Q9NSD7 469 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 POT1Q9NUX5 634 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 POLG2Q9UHN1 485 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 FRYLO94915 3013 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 CCDC189A1A4V9 331 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 C4orf47A7E2U8 309 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 AGPSO00116 658 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 COPEO14579 308 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 GSTA1P08263 222 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 CD1DP15813 335 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 SLC19A1P41440 591 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 HHEXQ03014 270 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 ACAP2Q15057 778 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 C14orf28Q4W4Y0 310 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 FRA10AC1Q70Z53 315 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 C4orf33Q8N1A6 199 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 OR5K2Q8NHB8 316 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 ZFPM2Q8WW38 1151 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 PATE1Q8WXA2 126 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 SCYL1Q96KG9 808 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa20.63■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 PCDH15Q96QU1 1955 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 TRIM38O00635 465 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 SIGLEC6O43699 453 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 NOBOXO60393 691 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 SASH3O75995 380 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 RBP1P09455 135 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 GIMD1P0DJR0 217 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 TFEBP19484 476 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 DBX2Q6ZNG2 339 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 SPNS2Q8IVW8 549 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 ARL14Q8N4G2 192 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 RAB42Q8N4Z0 105 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 FAM181AQ8N9Y4 354 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 GPR156Q8NFN8 814 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 OR6C4Q8NGE1 309 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 RHBDD1Q8TEB9 315 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 RAD51AP1Q96B01 352 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 PARVBQ9HBI1 364 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 IGSF5Q9NSI5 407 aa20.62■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 RHPN2P1A8MT19 583 aa20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 GFYI3L273 518 aa20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 GLRA3O75311 464 aa20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 C1orf105O95561 183 aa20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 GPS2Q13227 327 aa20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 PRKG2Q13237 762 aa20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 NR0B2Q15466 257 aa20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 KYQ8NBH2 561 aa20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 OR5AR1Q8NGP9 310 aa20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 KIAA1191Q96A73 305 aa20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 SLC12A9Q9BXP2 914 aa20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 GRID1Q9ULK0 1009 aa20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 RNF112Q9ULX5 631 aa20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 PADI4Q9UM07 663 aa20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.61■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 CDC7O00311 574 aa20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 ZW10O43264 779 aa20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 FASLGP48023 281 aa20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 GLRBP48167 497 aa20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 MAZP56270 477 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
YBX1-201ENST00000321358 DAB2P98082 770 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms