RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288050.8

PDPR-201, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 9,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-201ENST00000288050 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 ATG12O94817 140 aa9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 SLC25A27O95847 323 aa9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 NTRK2Q16620 822 aa9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 OR2T34Q8NGX1 318 aa9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 OR2T3Q8NH03 318 aa9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 SLC38A4Q969I6 547 aa9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 SERPINB11Q96P15 392 aa9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 FZD1Q9UP38 647 aa9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 SH2B3Q9UQQ2 575 aa9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 CHEK1O14757 476 aa9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 PEX11AO75192 247 aa9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 GPRC6AQ5T6X5 926 aa9.76□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 ZNF609O15014 1411 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 ENTPD5O75356 428 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 SLC3A1Q07837 685 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 SERINC3Q13530 473 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 TMEM246Q9BRR3 403 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 KATNBL1Q9H079 304 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 ICKQ9UPZ9 632 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 A0A0G2JN53 185 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 DNAJA2O60884 412 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 CAMLGP49069 296 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 SELENOVP59797 346 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 ERVK-9P63128 1117 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 C2orf80Q0P641 193 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 BNIP3Q12983 259 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 DNM1P34Q6PK57 102 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 OR52J3Q8NH60 311 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 ATG4CQ96DT6 458 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 FBRSQ9HAH7 460 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 GDF3Q9NR23 364 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 CAPN3P20807 821 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 ELOA3BQ3SY89 546 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 SEZ6Q53EL9 994 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 CES5AQ6NT32 575 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 ELOA3Q8NG57 546 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 ACTL9Q8TC94 416 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 COPS5Q92905 334 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 H0YGN5 161 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 TNFRSF10BO14763 440 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 MYL6P60660 151 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 LIPMQ5VYY2 423 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 ELMOD2Q8IZ81 293 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 LZTR1Q8N653 840 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 OR4C15Q8NGM1 316 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 RDH11Q8TC12 318 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 VCPIP1Q96JH7 1222 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 KCNE2Q9Y6J6 123 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 MPPED1O15442 326 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 JUNP05412 331 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 ZNF136P52737 540 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 OR12D2P58182 307 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 RASGEF1CQ8N431 466 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 YIPF7Q8N8F6 280 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 ARRDC4Q8NCT1 418 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 SUN3Q8TAQ9 357 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 ARL8BQ9NVJ2 186 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 TUBE1Q9UJT0 475 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 FAM205CA6NFA0 338 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 MYO9BQ13459 2157 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 CASTOR2A6NHX0 329 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 C22orf31O95567 290 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 MAPK8P45983 427 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 CCR10P46092 362 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 KLK7P49862 253 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 DPY19L4Q7Z388 723 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 P4HA3Q7Z4N8 544 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 SPATA20Q8TB22 786 aa9.75□□□□□ -0.85
PDPR-201ENST00000288050 CEP41Q9BYV8 373 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms