RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 ITM2CQ9NQX7 267 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 FAM234BA2RU67 622 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 WNT9AO14904 365 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SAGP10523 405 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 PROZP22891 400 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ECT2LQ008S8 904 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 FAAH2Q6GMR7 532 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SMYD5Q6GMV2 418 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 GALNT5Q7Z7M9 940 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 AMZ2Q86W34 360 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ZZZ3Q8IYH5 903 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 MCFD2Q8NI22 146 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 DNASE1L2Q92874 299 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 NECTIN3Q9NQS3 549 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 FAM149AA5PLN7 773 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SLC31A1O15431 190 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 GALNT2Q10471 571 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 GPR17Q13304 367 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SNAPC1Q16533 368 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD46Q86W74 232 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SVOPLQ8N434 492 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 FAM156AQ8NDB6 213 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 CIDEBQ9UHD4 219 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 CITO14578 2027 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 TNFRSF21O75509 655 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 AP1S2P56377 157 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 HERC3Q15034 1050 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 DDI2Q5TDH0 399 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 OAFQ86UD1 273 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 EFCAB11Q9BUY7 163 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 CCSER2Q9H7U1 834 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 HS3ST4Q9Y661 456 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 UBE2QL1A1L167 161 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 FAM72CH0Y354 149 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 J3KR12 359 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 NIPSNAP2O75323 286 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 KRT33AO76009 404 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 AHSGP02765 367 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 MT-ND1P03886 318 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 HSD17B2P37059 387 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 QPRTQ15274 297 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SNAP47Q5SQN1 464 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 FAM72AQ5TYM5 149 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 EMC10Q5UCC4 262 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 FAM72DQ6L9T8 149 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 RPTNQ6XPR3 784 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 FAM72BQ86X60 149 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 OR2AP1Q8NGE2 309 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 NSMCE3Q96MG7 304 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 TXLNGYQ9BZA5 131 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SLC7A8Q9UHI5 535 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 MCM8Q9UJA3 840 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 LYNP07948 512 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ITGAXP20702 1163 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 RPS6KA3P51812 740 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 PYDC2Q56P42 97 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 GDPD4Q6W3E5 623 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 CEP68Q76N32 757 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 LMLNQ96KR4 655 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ADAMTS10Q9H324 1103 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 INSL6Q9Y581 213 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 BTAF1O14981 1849 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 CCDC182A6NF36 153 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 E7ESA3 106 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 CXCR6O00574 342 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 DNAJB1P25685 340 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 IGFALSP35858 605 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 IFI44LQ53G44 452 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 BRAT1Q6PJG6 821 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 CYP2U1Q7Z449 544 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 FLCNQ8NFG4 579 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM40Q8WWA1 233 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 EBPLQ9BY08 206 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 DPEP2Q9H4A9 486 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 EXO5Q9H790 373 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 GON4LQ3T8J9 2241 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRS-201ENST00000262963 MPZL2O60487 215 aa11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms