RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	GLUD1	P00367	558 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ADRM1	Q16186	407 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC66	Q68CR7	880 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO30	Q8TB52	745 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ITFG1	Q8TB96	612 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CD84	Q9UIB8	345 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TTC36	A6NLP5	189 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TEX28	O15482	410 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	RGS14	O43566	566 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	KCNH1	O95259	989 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	SPAM1	P38567	509 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PPP3CC	P48454	512 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	RAB33A	Q14088	237 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CDKN3	Q16667	212 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	SPRED1	Q7Z699	444 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PROSER1	Q86XN7	944 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	NXPE1	Q8N323	547 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	DPP10	Q8N608	796 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	MYLIP	Q8WY64	445 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PYCR2	Q96C36	320 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	DPY30	Q9C005	99 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	MUC13	Q9H3R2	512 aa		12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PRU2	124 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152		K7EPI3	171 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	IGSF6	O95976	241 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ASL	P04424	464 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	EPB42	P16452	691 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MYF6	P23409	242 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINA4	P29622	427 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	IST1	P53990	364 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PWP1	Q13610	501 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GTDC1	Q4AE62	458 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ACD	Q96AP0	544 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ARL15	Q9NXU5	204 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MTX2	O75431	263 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CXCL10	P02778	98 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	UMPS	P11172	480 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	JAK1	P23458	1154 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	RPIA	P49247	311 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CLCN2	P51788	898 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	NEK2	P51955	445 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	TLE2	Q04725	743 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CRY1	Q16526	586 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SPATS1	Q496A3	300 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	OR2T12	Q8NG77	320 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF583	Q96ND8	569 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB18	Q99592	522 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	BDH2	Q9BUT1	245 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ACTR8	Q9H981	624 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GFRA2	O00451	464 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GSTA4	O15217	222 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GMNN	O75496	209 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	STK16	O75716	305 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	NPPA	P01160	153 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	GNPDA1	P46926	289 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	ALDH3B2	P48448	385 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BRF1-222	ENST00000635152	DEFB103A	P81534	67 aa		12.82	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms