RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 EGFL8Q99944 293 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNK4Q9NYG8 393 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PCTPQ9UKL6 214 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 DMTF1Q9Y222 760 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ASB1Q9Y576 335 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 USH1CQ9Y6N9 552 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD12Q6UB98 2062 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF195O14628 629 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ANXA5P08758 320 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 NUDT1P36639 197 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 HK2P52789 917 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ARFIP2P53365 341 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CDH13P55290 713 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 YPEL5P62699 121 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 NFATC4Q14934 902 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 MCOLN3Q8TDD5 553 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ESAMQ96AP7 390 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PLCD4Q9BRC7 762 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ARL15Q9NXU5 204 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 EBAG9O00559 213 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 E2F3O00716 465 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 TOR1BO14657 336 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 HIST1H2ADP20671 130 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 CXCL12P48061 93 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 AQP5P55064 265 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 AP1S2P56377 157 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 CLCQ05315 142 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 DMPKQ09013 629 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 PYCR3Q53H96 274 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 METRNLQ641Q3 311 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 C6orf89Q6UWU4 347 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 CUZD1Q86UP6 607 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 AGR3Q8TD06 166 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 UBTD2Q8WUN7 234 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 FOPNLQ96NB1 174 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 HIST1H2AJQ99878 128 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM79Q9BSE2 394 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 TIMM29Q9BSF4 260 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 H2AFJQ9BTM1 129 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52A5Q9H2C5 316 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 FGF22Q9HCT0 170 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 SUFUQ9UMX1 484 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF33A8MVX0 844 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN8P19075 237 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 KELP23276 732 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 ACADLP28330 430 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 MAMSTRQ6ZN01 415 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 MAVSQ7Z434 540 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 OR56A4Q8NGH8 313 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP61Q8NHU2 1237 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 RMDN2Q96LZ7 410 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB26Q9HCK0 441 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 ERICH4A6NGS2 130 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 K7ESF4 209 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 MATN2O00339 956 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 CATP04040 527 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 GGT5P36269 586 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 SIGLEC14Q08ET2 396 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 LCP2Q13094 533 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 SH2D4BQ5SQS7 431 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 TPRG1LQ5T0D9 272 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 GALNT13Q8IUC8 556 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 TCAIMQ8N3R3 496 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 TRPC4APQ8TEL6 797 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR92Q96MX6 357 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 ORAI3Q9BRQ5 295 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 CD244Q9BZW8 370 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 WWOXQ9NZC7 414 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PPC4 97 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS38A1L453 326 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 SLCO1B7G3V0H7 640 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP6CO00743 305 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNJ13O60928 360 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 HTR1BP28222 390 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEA9P43362 315 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPA7P48741 367 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-215ENST00000628018 HNMTP50135 292 aa24.3■■□□□ 1.48
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