RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568870.1

TCF25-223, Transcript of transcription factor 25, human

TSL 2

Gene TCF25, Length 263 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF25-223	ENST00000568870	PHC3	Q8NDX5	983 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	GPR156	Q8NFN8	814 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	NETO1	Q8TDF5	533 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	ZBTB9	Q96C00	473 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	FOPNL	Q96NB1	174 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	SNX15	Q9NRS6	342 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	PADI4	Q9UM07	663 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	ASF1A	Q9Y294	204 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	CPED1	A4D0V7	1026 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	CDH16	O75309	829 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	MPC1L	P0DKB6	136 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	KRT15	P19012	456 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	CRABP2	P29373	138 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	SLC19A1	P41440	591 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	LIMK1	P53667	647 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	HHEX	Q03014	270 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	KRT71	Q3SY84	523 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	MTBP	Q96DY7	904 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	ZIM3	Q96PE6	472 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	VPS11	Q9H270	941 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	POT1	Q9NUX5	634 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	TLK1	Q9UKI8	766 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	NFS1	Q9Y697	457 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870		A0A096LPK6	155 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	TCEA3	O75764	348 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	CCDC166	P0CW27	439 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	ACADL	P28330	430 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	GMPR	P36959	345 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	PLA2G5	P39877	138 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	BDKRB1	P46663	353 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF844	Q08AG5	666 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	CASP8	Q14790	479 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	PROX2	Q3B8N5	592 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	TDRP	Q86YL5	185 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	AVL9	Q8NBF6	648 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	RUFY1	Q96T51	708 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	HGH1	Q9BTY7	390 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	SLC32A1	Q9H598	525 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	ACOT9	Q9Y305	439 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870		A0A087X1B8	175 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	TSPAN12	O95859	305 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	RPN2	P04844	631 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	C2	P06681	752 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	CKMT1A	P12532	417 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	GLB1	P16278	677 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	CKMT2	P17540	419 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	NDUFS1	P28331	727 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	IRF9	Q00978	393 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	DNAJC3	Q13217	504 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	PRKG2	Q13237	762 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	CSHL1	Q14406	222 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF25-223	ENST00000568870	PLCL1	Q15111	1095 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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