RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551592.5

SENP1-208, Transcript of SUMO specific peptidase 1, human

TSL 3

Gene SENP1, Length 866 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SENP1-208	ENST00000551592	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	NSMAF	Q92636	917 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	RAD54L	Q92698	747 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	FN3K	Q9H479	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TMEM206	Q9H813	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592		Q9N2K0	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PPEF2	O14830	753 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	MT-ND3	P03897	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	WNT5A	P41221	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	UBASH3A	P57075	661 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ASIC1	P78348	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	DSC1	Q08554	894 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	AP1B1	Q10567	949 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PIM3	Q86V86	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	KRT35	Q92764	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TANK	Q92844	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	EXOC4	Q96A65	974 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	MTERF3	Q96E29	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SPATA33	Q96N06	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SOCS2	O14508	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	GPR137B	O60478	399 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	LDB3	O75112	727 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	RTN2	O75298	545 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	KDM4B	O94953	1096 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	MOCS3	O95396	460 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	WDPCP	O95876	746 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TOMM40	O96008	361 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	GLUD1	P00367	558 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	MYOD1	P15172	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	GM2A	P17900	193 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PTMS	P20962	102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CD38	P28907	300 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CASP3	P42574	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	KCNJ1	P48048	391 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	GLUD2	P49448	558 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	MAPK12	P53778	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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