RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 RXRGP48443 463 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 BLKP51451 505 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 CLCN7P51798 805 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 CDKN2DP55273 166 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 TAS2R39P59534 338 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 GBX1Q14549 363 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 LGSNQ5TDP6 509 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 CRTC3Q6UUV7 619 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 TIFABQ6ZNK6 161 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 PHACTR4Q8IZ21 702 aa16.49■□□□□ 0.23
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PACS1-208ENST00000529677 GPATCH11Q8N954 259 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 OR2L2Q8NH16 312 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 HM13Q8TCT9 377 aa16.49■□□□□ 0.23
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PACS1-208ENST00000529677 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa16.49■□□□□ 0.23
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PACS1-208ENST00000529677 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 ZNF446Q9NWS9 450 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 TAS2R13Q9NYV9 303 aa16.49■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
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PACS1-208ENST00000529677 MGAT4DA6NG13 374 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 IQCF5A8MTL0 148 aa16.48■□□□□ 0.23
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PACS1-208ENST00000529677 VPS26AO75436 327 aa16.48■□□□□ 0.23
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PACS1-208ENST00000529677 TNFP01375 233 aa16.48■□□□□ 0.23
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PACS1-208ENST00000529677 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 SLCO1A2P46721 670 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 GNPDA1P46926 289 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 TMPRSS3P57727 454 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 BMPR2Q13873 1038 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 HID1Q8IV36 788 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 KRT222Q8N1A0 295 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 GIMAP7Q8NHV1 300 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 CD200R1Q8TD46 325 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 GPBAR1Q8TDU6 330 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 SAP25Q8TEE9 199 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 ELMO2Q96JJ3 720 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 PKNOX2Q96KN3 472 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 SLC23A2Q9UGH3 650 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 IL17BQ9UHF5 180 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 DHRS7Q9Y394 339 aa16.48■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 SLC5A10A0PJK1 596 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 TRIM49D1C9J1S8 452 aa16.47■□□□□ 0.23
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PACS1-208ENST00000529677 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 GPC4O75487 556 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 ATP5DP30049 168 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 SERPINB8P50452 374 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 MROH9Q5TGP6 573 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 UGT3A1Q6NUS8 523 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 CCDC91Q7Z6B0 441 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 AMZ2Q86W34 360 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 CEP97Q8IW35 865 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 PGM2Q96G03 612 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 GPR21Q99679 349 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 SLC30A3Q99726 388 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 LRRC61Q9BV99 259 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 GALPQ9UBC7 116 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 SLC39A10Q9ULF5 831 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 CDYLQ9Y232 598 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 PRKAB1Q9Y478 270 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 ST14Q9Y5Y6 855 aa16.47■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 LRRK2Q5S007 2527 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 E5RI56 91 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 H3BM21 787 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 AGPSO00116 658 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 DFNA5O60443 496 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 SASH3O75995 380 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 ACP5P13686 325 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 STMN1P16949 149 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 JUNDP17535 347 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 VCLP18206 1134 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 CHRM3P20309 590 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 CRABP2P29373 138 aa16.46■□□□□ 0.23
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