RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 MPC1LP0DKB6 136 aa18.27■□□□□ 0.52
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PTPRK-218ENST00000525459 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRK-218ENST00000525459 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRK-218ENST00000525459 GUSBP11Q6P575 273 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM26Q6ZUK4 368 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRK-218ENST00000525459 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRK-218ENST00000525459 ACVR1CQ8NER5 493 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRK-218ENST00000525459 ISL2Q96A47 359 aa18.24■□□□□ 0.51
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