RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 GPR26Q8NDV2 337 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 RHEBL1Q8TAI7 183 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 TRIM54Q9BYV2 358 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 P2RY12Q9H244 342 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 COQ10BQ9H8M1 238 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 PKP3Q9Y446 797 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 SNX13Q9Y5W8 968 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 MYLKQ15746 1914 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 DHRS12A0PJE2 317 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 TBC1D3BA6NDS4 549 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 PRORSD1PA6NEY8 169 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 ANTXRLA6NF34 631 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 TRIM64CA6NLI5 447 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 K7EQS6 105 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 TNFRSF10AO00220 468 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 FBP2O00757 339 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 SPINT1O43278 529 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 AKAP10O43572 662 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 C1SP09871 688 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 UMPSP11172 480 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF30P17039 623 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 FASP25445 335 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 VIPR1P32241 457 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 PTGER3P43115 390 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 SPINT3P49223 89 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 TTPAP49638 278 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 GALK1P51570 392 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 SLC7A2P52569 658 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 GPR33Q49SQ1 333 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 MTX3Q5HYI7 312 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 C6orf10Q5SRN2 563 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 TMTC4Q5T4D3 741 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 LRRC66Q68CR7 880 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 LPCAT2Q7L5N7 544 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 GPR141Q7Z602 305 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 SNX20Q7Z614 316 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 STK40Q8N2I9 435 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 LRTOMTQ8WZ04 291 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 SGF29Q96ES7 293 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 FAM210AQ96ND0 272 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 CYP4F12Q9HCS2 524 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC167Q9P0B6 97 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 ACTR3BQ9P1U1 418 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 SUN2Q9UH99 717 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 PACSIN3Q9UKS6 424 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 CRYL1Q9Y2S2 319 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 CEPT1Q9Y6K0 416 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 COL4A3Q01955 1670 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 SYCE1LA8MT33 242 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 AREL1O15033 823 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 NPC1O15118 1278 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 PFDN6O15212 129 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 BNIP3LO60238 219 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 NOL3O60936 208 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 SUPT7LO94864 414 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 CHEK2O96017 543 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 NPPAP01160 153 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 PRNPP04156 253 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 LBPP18428 481 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 GPX3P22352 226 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 MYF6P23409 242 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 IL12RB1P42701 662 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 RALGDSQ12967 914 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 NFATC2Q13469 925 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 CHRNA6Q15825 494 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-208ENST00000486964 TBCELQ5QJ74 424 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms