RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	CER1	O95813	267 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	IGLV3-19	P01714	112 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	KLKB1	P03952	638 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	RALA	P11233	206 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	RARG	P13631	454 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCDC130	P13994	396 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	ACVR2A	P27037	513 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	TPMT	P51580	245 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	NDST1	P52848	882 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	MFAP3	P55082	362 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	COG7	P83436	770 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	GRIK2	Q13002	908 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	CNGA2	Q16280	664 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	HLA-B	Q31612	363 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	FUT11	Q495W5	492 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	C12orf29	Q8N999	325 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	DHX58	Q96C10	678 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZPBP	Q9BS86	351 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPR174	Q9BXC1	333 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	DUSP16	Q9BY84	665 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNRNP40-205	ENST00000486941	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	MDM4	O15151	490 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	MAPK13	O15264	365 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	FLRT2	O43155	660 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	KLRC4	O43908	158 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	RFPL1	O75677	317 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	NR3C1	P04150	777 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	ACADM	P11310	421 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	BRAF	P15056	766 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	ADORA2B	P29275	332 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	CASP1	P29466	404 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	MATK	P42679	507 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	BNC1	Q01954	994 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	ENPEP	Q07075	957 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	STK4	Q13043	487 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	CUL4B	Q13620	913 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF234	Q14588	700 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	ATL3	Q6DD88	541 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	SCD5	Q86SK9	330 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNRNP40-205	ENST00000486941	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76

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