RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 CDC7O00311 574 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 KCNJ13O60928 360 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 CAPN1P07384 714 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 POU2F2P09086 479 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 NCALDP61601 193 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 MAPKAPK3Q16644 382 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 IRGCQ6NXR0 463 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 BHLHB9Q6PI77 547 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 Q6ZNB5 142 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 SLC9B2Q86UD5 537 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 MYLK2Q9H1R3 596 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 IL26Q9NPH9 171 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 KLHL3Q9UH77 587 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 TIMM22Q9Y584 194 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 A8MT66 165 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 WASH3PC4AMC7 463 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 OR4F21O95013 312 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 F7P08709 466 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 HPGDP15428 266 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 TIMP2P16035 220 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 ASMTP46597 345 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 EPHA5P54756 1037 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 GPR180Q86V85 440 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 C11orf74Q86VG3 221 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 TTLQ8NG68 377 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 LMX1AQ8TE12 382 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 ESAMQ96AP7 390 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 RMI1Q9H9A7 625 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 KCNK12Q9HB15 430 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 PREBQ9HCU5 417 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 OR1F1O43749 312 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 EPN2O95208 641 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 RABIFP47224 123 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 CYP4F2P78329 520 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 PLPP6Q8IY26 295 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 C1orf50Q9BV19 199 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 ITM2BQ9Y287 266 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 NFS1Q9Y697 457 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 SCN1AP35498 2009 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 DYTNA2CJ06 578 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 PLK4O00444 970 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM24O15164 1050 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 SLC16A5O15375 505 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 LDB2O43679 373 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 KCNH1O95259 989 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 MPC1LP0DKB6 136 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 SCTRP47872 440 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 RFX3P48380 749 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 KCNC3Q14003 757 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM40Q6P9F5 258 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 LIPIQ6XZB0 460 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 GPR150Q8NGU9 434 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 MAGED4Q96JG8 741 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 APOLD1Q96LR9 279 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 AXIN1O15169 862 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 SLC22A3O75751 556 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 PREPP48147 710 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 CCR8P51685 355 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 GRIN2CQ14957 1233 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 TRIB3Q96RU7 358 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 DLX3O60479 287 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 GLULP15104 373 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 CHRNB3Q05901 458 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 TGFBIQ15582 683 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 ANXA8L1Q5VT79 327 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 OR9A1PQ8NGU1 263 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 RHEBL1Q8TAI7 183 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 WFDC5Q8TCV5 224 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 LMLNQ96KR4 655 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
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