RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474230.5

NFU1-209, Transcript of NFU1 iron-sulfur cluster scaffold, human

TSL 3

Gene NFU1, Length 666 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFU1-209	ENST00000474230	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	ZG16	O60844	167 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	NR3C1	P04150	777 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	SLC15A1	P46059	708 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	MC1R	Q01726	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	CREB5	Q02930	508 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	MIOS	Q9NXC5	875 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	DEPDC5	O75140	1603 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	ERVK-7	P63135	1459 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	ABCC3	O15438	1527 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230		A6NCN8	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	GPR137B	O60478	399 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	CIDEA	O60543	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	LDLR	P01130	860 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	THOP1	P52888	689 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	CCDC6	Q16204	474 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	HYI	Q5T013	277 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	MAF1	Q9H063	256 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	SLC22A2	O15244	555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	PCDH7	O60245	1069 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	CBL	P22681	906 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	HOXC8	P31273	242 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	MEA1	Q16626	185 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	KLC3	Q6P597	504 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	AACS	Q86V21	672 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	OR2T12	Q8NG77	320 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	LITAF	Q99732	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	PIK3R4	Q99570	1358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	NOS1	P29475	1434 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	SLIT1	O75093	1534 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230		A0A1W2PQ09	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230	OR2A25	A4D2G3	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NFU1-209	ENST00000474230		B4DLN1	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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