RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469025.1

OPTN-209, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 642 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-209ENST00000469025 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 PDXPQ96GD0 296 aa5.06□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 LRFN5Q96NI6 719 aa5.06□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 OLFM1Q99784 485 aa5.06□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 ZMYND12Q9H0C1 365 aa5.06□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 MMP27Q9H306 513 aa5.06□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 WASH6PQ9NQA3 447 aa5.06□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 P4HTMQ9NXG6 502 aa5.06□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 DNAI1Q9UI46 699 aa5.06□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 STOML2Q9UJZ1 356 aa5.06□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 SPTBP11277 2137 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 ATP8B3O60423 1300 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 UBE2QL1A1L167 161 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 IGLON5A6NGN9 336 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 SYT5O00445 386 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 AP1G1O43747 822 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 GPRIN2O60269 458 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 TOX4O94842 621 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 TDP2O95551 362 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 WDPCPO95876 746 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 SERPINC1P01008 464 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 JUNP05412 331 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 CAPN1P07384 714 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 SP1P08047 785 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 SDSP20132 328 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 HNF1AP20823 631 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 OTX2P32243 289 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 NNMTP40261 264 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 ARG2P78540 354 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 ADCY2Q08462 1091 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 GPS2Q13227 327 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 ETFDHQ16134 617 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 KYAT1Q16773 422 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 PITRM1Q5JRX3 1037 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 C10orf120Q5SQS8 335 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 KRT79Q5XKE5 535 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 ATG9BQ674R7 924 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 KCTD16Q68DU8 428 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 ZNF662Q6ZS27 426 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 OTOAQ7RTW8 1153 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 LRRC52Q8N7C0 313 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 CCL4L1Q8NHW4 92 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 FIBINQ8TAL6 211 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 MRAPQ8TCY5 172 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 SMPDL3BQ92485 455 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 HAS2Q92819 552 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 IFT74Q96LB3 600 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 FAM227BQ96M60 508 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 MAP3K3Q99759 626 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 FBXO44Q9H4M3 255 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 DYRK4Q9NR20 520 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 GDAP2Q9NXN4 497 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 ARL15Q9NXU5 204 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 DPP3Q9NY33 737 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 C2CD2Q9Y426 696 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 FADS3Q9Y5Q0 445 aa5.05□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 PP2D1A8MPX8 630 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 CLDN3O15551 220 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 DAPK3O43293 454 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 FAM189A1O60320 539 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 CTSLP07711 333 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 CCDC166P0CW27 439 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 ZNF18P17022 549 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 SLC9A1P19634 815 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 LMO2P25791 158 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 FASLGP48023 281 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 STK19P49842 368 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 GSDMDP57764 484 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 MLF1P58340 268 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 VLDLRP98155 873 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 ACKR1Q16570 336 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 TMEM249Q2WGJ8 235 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 LCN10Q6JVE6 187 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 MOXD1Q6UVY6 613 aa5.04□□□□□ -1.6
OPTN-209ENST00000469025 FAM198BQ6UWH4 519 aa5.04□□□□□ -1.6
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