RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 GPR107Q5VW38 600 aa5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 KBTBD2Q8IY47 623 aa5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 AVL9Q8NBF6 648 aa5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 HSPBAP1Q96EW2 488 aa5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 FOPNLQ96NB1 174 aa5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 CSPG4P5Q96PW8 444 aa5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 NMRAL1Q9HBL8 299 aa5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 GID8Q9NWU2 228 aa5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 C2orf42Q9NWW7 574 aa5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 SOHLH2Q9NX45 425 aa5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 HACD3Q9P035 362 aa5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 HS3ST2Q9Y278 367 aa5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 CA5BQ9Y2D0 317 aa5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa5.9□□□□□ -1.46
SHQ1-205ENST00000468371 H3BSA7 217 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ARNTLO00327 626 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 GFAPP14136 432 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 MPSTP25325 297 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 GMPRP36959 345 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NR2C2P49116 596 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PSMD7P51665 324 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NUP107P57740 925 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 OGDHQ02218 1023 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FOXM1Q08050 763 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RALGDSQ12967 914 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CSHL1Q14406 222 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 MAPRE2Q15555 327 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ARCQ7LC44 396 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SUMF1Q8NBK3 374 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 OR52K1Q8NGK4 314 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 OR10G6Q8NH81 332 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NXPE2Q96DL1 559 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RNF157Q96PX1 679 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 GPAMQ9HCL2 828 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NDFIP2Q9NV92 336 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PILRBQ9UKJ0 227 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 BAG5Q9UL15 447 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 AP4S1Q9Y587 144 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 A0A1W2PQF6 199 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 J3KR12 359 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RNF103O00237 685 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CLOCKO15516 846 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 AQP9O43315 295 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RFPL3O75679 317 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PAMP19021 973 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PIK3R1P27986 724 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 GBE1Q04446 702 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 POU6F1Q14863 301 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FAM83EQ2M2I3 478 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 C6orf10Q5SRN2 563 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PERM1Q5SV97 790 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SLC23A3Q6PIS1 610 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CRTC3Q6UUV7 619 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC81Q6ZN84 652 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PIM3Q86V86 326 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 MPP5Q8N3R9 675 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PHTF2Q8N3S3 785 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NAT8LQ8N9F0 302 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FAM47BQ8NA70 645 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 OR6C4Q8NGE1 309 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 OR2A12Q8NGT7 310 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ZFAND2BQ8WV99 257 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 HTR3CQ8WXA8 447 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 MOCOSQ96EN8 888 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 C7orf26Q96N11 449 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 VAT1Q99536 393 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF670Q9BS34 389 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CD84Q9UIB8 345 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PSMD13Q9UNM6 376 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CLCA2Q9UQC9 943 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 COQ6Q9Y2Z9 468 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms