RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460170.2

PTPRU-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-205ENST00000460170 CGREF1Q99674 301 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 DERL2Q9GZP9 239 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 PRAMEF11O60813 436 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 TSC22D2O75157 780 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 NUDT14O95848 222 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 RPL26P61254 145 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CYP4F8P98187 520 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 SCLYQ96I15 445 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CCR10P46092 362 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 GSK3BP49841 420 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 FOXM1Q08050 763 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 MTAPQ13126 283 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 DENND5AQ6IQ26 1287 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 AHSA2Q719I0 299 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 OR52J3Q8NH60 311 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 C1orf74Q96LT6 269 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 TMCC2O75069 709 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 NFATC1O95644 943 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CDH1P12830 882 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 NFKB2Q00653 900 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 TEAD4Q15561 434 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 STEAP4Q687X5 459 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 PDPRQ8NCN5 879 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 SLITRK2Q9H156 845 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 NENFQ9UMX5 172 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 IL12RB1P42701 662 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 MAGEA11P43364 429 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 DAG1Q14118 895 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 UPP1Q16831 310 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 MZT2BQ6NZ67 158 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 PDSS2Q86YH6 399 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 PHC3Q8NDX5 983 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 RTP4Q96DX8 246 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 ASB3Q9Y575 518 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 PDLIM1O00151 329 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 MTTPP55157 894 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 OR5K1Q8NHB7 308 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 OLFM1Q99784 485 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 ACTR3BQ9P1U1 418 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 A0A1W2PP18 115 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 OR10H2O60403 315 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 PTPN2P17706 415 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 MAPK12P53778 367 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 TAS2R41P59536 307 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 FAM92BQ6ZTR7 304 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 EXD2Q9NVH0 621 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 PLK4O00444 970 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 CAP1Q01518 475 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 SCAPQ12770 1279 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 TRPV3Q8NET8 790 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 ARVCFO00192 962 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 NOBOXO60393 691 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 GPR32O75388 356 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 AMD1P17707 334 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 RPS6KA3P51812 740 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF678Q5SXM1 525 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 PYCR2Q96C36 320 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 CAPNS2Q96L46 248 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 DUSP26Q9BV47 211 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 PRG2P13727 222 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 NR4A1P22736 598 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 IL12AP29459 219 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 DGKQP52824 942 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 CHRNA6Q15825 494 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 SFT2D3Q587I9 215 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 CARD16Q5EG05 197 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 MTMR11A4FU01 709 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-205ENST00000460170 HAS3O00219 553 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms